>letter-probability matrix MA0206.1 abd-A: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.055556 0.166667 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.111111 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.333333 0.666667 0.833333 0.055556 0.111111 0.000000 >letter-probability matrix MA0165.1 Abd-B: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.761905 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.142857 0.000000 0.857143 0.142857 0.000000 0.523810 0.333333 0.619048 0.000000 0.238095 0.142857 >letter-probability matrix MA0207.1 achi: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.043478 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.176471 0.000000 0.705882 0.117647 >letter-probability matrix MA0208.1 al: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 >letter-probability matrix MA0166.1 Antp: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.062500 0.000000 0.875000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.562500 0.437500 0.937500 0.000000 0.062500 0.000000 >letter-probability matrix MA0209.1 ap: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.105263 0.526316 0.000000 0.368421 0.052632 0.000000 0.000000 0.947368 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.315789 0.684211 0.842105 0.000000 0.157895 0.000000 >letter-probability matrix MA0210.1 ara: alength= 4 w= 5 nsites= 34 E= 0 0.411765 0.000000 0.147059 0.441176 0.676471 0.000000 0.000000 0.323529 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0167.1 Awh: alength= 4 w= 7 nsites= 40 E= 0 0.075000 0.400000 0.000000 0.525000 0.025000 0.000000 0.000000 0.975000 0.825000 0.000000 0.175000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.025000 0.975000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.850000 0.000000 0.100000 0.050000 >letter-probability matrix MA0168.1 B-H1: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.190476 0.190476 0.000000 0.619048 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.380952 0.000000 0.000000 0.619048 0.047619 0.333333 0.000000 0.619048 0.047619 0.000000 0.952381 0.000000 >letter-probability matrix MA0169.1 B-H2: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.095238 0.047619 0.571429 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.761905 0.142857 0.047619 0.095238 0.714286 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0211.1 bap: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.000000 0.956522 0.304348 0.000000 0.695652 0.000000 >letter-probability matrix MA0212.1 bcd: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.909091 0.000000 0.000000 0.090909 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.954545 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.954545 0.000000 0.045455 >letter-probability matrix MA0529.2 BEAF-32: alength= 4 w= 12 nsites= 5502 E= 0 0.322065 0.190476 0.282806 0.204653 0.292984 0.331698 0.129226 0.246092 0.097964 0.083606 0.017630 0.800800 0.936205 0.009269 0.017448 0.037077 0.017812 0.020356 0.014358 0.947474 0.004726 0.985642 0.002363 0.007270 0.007270 0.002363 0.985642 0.004726 0.947474 0.014358 0.020356 0.017812 0.037077 0.017448 0.009269 0.936205 0.800800 0.017630 0.083606 0.097964 0.246092 0.129226 0.331698 0.292984 0.204653 0.282806 0.190476 0.322065 >letter-probability matrix MA0242.1 Bgb::run: alength= 4 w= 9 nsites= 29 E= 0 0.413793 0.068966 0.000000 0.517241 0.931034 0.000000 0.034483 0.034483 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.172414 0.034483 0.793103 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.689655 0.000000 0.310345 0.000000 >letter-probability matrix MA0010.1 br: alength= 4 w= 14 nsites= 9 E= 0 0.333333 0.111111 0.444444 0.111111 0.111111 0.111111 0.111111 0.666667 0.555556 0.222222 0.111111 0.111111 0.777778 0.000000 0.111111 0.111111 0.333333 0.000000 0.000000 0.666667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.444444 0.111111 0.444444 0.000000 0.777778 0.000000 0.111111 0.111111 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.111111 0.000000 0.555556 0.000000 0.333333 0.111111 0.444444 0.000000 0.000000 0.555556 0.222222 0.333333 0.222222 0.222222 >letter-probability matrix MA0011.1 br_var.2: alength= 4 w= 8 nsites= 12 E= 0 0.250000 0.083333 0.083333 0.583333 0.416667 0.166667 0.083333 0.333333 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.000000 0.083333 0.000000 0.916667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.083333 0.083333 0.166667 0.666667 0.166667 0.000000 0.083333 0.750000 0.083333 0.166667 0.083333 0.666667 >letter-probability matrix MA0012.1 br_var.3: alength= 4 w= 11 nsites= 12 E= 0 0.250000 0.083333 0.083333 0.583333 0.750000 0.166667 0.083333 0.000000 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.833333 0.083333 0.083333 0.333333 0.000000 0.000000 0.666667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.500000 0.000000 0.333333 0.166667 0.500000 0.083333 0.166667 0.250000 0.333333 0.250000 0.166667 0.250000 0.166667 0.250000 0.416667 0.166667 >letter-probability matrix MA0013.1 br_var.4: alength= 4 w= 11 nsites= 6 E= 0 0.166667 0.166667 0.000000 0.666667 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.833333 0.000000 0.166667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.000000 0.166667 0.500000 0.166667 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.500000 0.166667 0.000000 0.333333 >letter-probability matrix MA0213.1 brk: alength= 4 w= 8 nsites= 10 E= 0 0.100000 0.500000 0.400000 0.000000 0.000000 0.400000 0.000000 0.600000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.800000 0.000000 0.100000 0.000000 0.500000 0.100000 0.400000 >letter-probability matrix MA0214.1 bsh: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.187500 0.125000 0.625000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.062500 0.000000 0.937500 0.000000 0.187500 0.375000 0.437500 0.437500 0.000000 0.562500 0.000000 >letter-probability matrix MA0443.1 btd: alength= 4 w= 10 nsites= 30 E= 0 0.466667 0.100000 0.233333 0.200000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.133333 0.000000 0.600000 0.266667 0.066667 0.000000 0.933333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.066667 0.933333 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 0.500000 0.033333 0.333333 0.133333 >letter-probability matrix MA0215.1 btn: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.217391 0.043478 0.173913 0.565217 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.652174 0.347826 0.826087 0.000000 0.130435 0.043478 >letter-probability matrix MA0170.1 C15: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.052632 0.052632 0.000000 0.894737 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.894737 0.000000 0.000000 0.105263 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.315789 0.105263 0.000000 0.578947 0.000000 0.157895 0.315789 0.526316 0.526316 0.000000 0.473684 0.000000 >letter-probability matrix MA0216.2 cad: alength= 4 w= 11 nsites= 2303 E= 0 0.370821 0.000000 0.496309 0.132870 0.249674 0.148068 0.602258 0.000000 0.000000 0.643074 0.000000 0.356926 0.323491 0.640469 0.000000 0.036040 0.919236 0.000000 0.080764 0.000000 0.000000 0.041251 0.000000 0.958749 0.970908 0.000000 0.000000 0.029092 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.710812 0.049935 0.063830 0.175423 0.454190 0.327833 0.000000 0.217977 >letter-probability matrix MA0217.1 caup: alength= 4 w= 5 nsites= 19 E= 0 0.210526 0.052632 0.105263 0.631579 0.736842 0.000000 0.105263 0.157895 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0015.1 Cf2: alength= 4 w= 10 nsites= 80 E= 0 0.312500 0.162500 0.500000 0.025000 0.012500 0.025000 0.012500 0.950000 0.925000 0.025000 0.050000 0.000000 0.000000 0.112500 0.050000 0.837500 0.975000 0.025000 0.000000 0.000000 0.012500 0.050000 0.012500 0.925000 0.512500 0.025000 0.450000 0.012500 0.025000 0.112500 0.012500 0.850000 0.662500 0.037500 0.250000 0.050000 0.150000 0.362500 0.187500 0.300000 >letter-probability matrix MA0171.1 CG11085: alength= 4 w= 7 nsites= 13 E= 0 0.000000 0.230769 0.000000 0.769231 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.076923 0.000000 0.000000 0.923077 0.153846 0.076923 0.153846 0.615385 0.076923 0.000000 0.923077 0.000000 >letter-probability matrix MA0172.1 CG11294: alength= 4 w= 7 nsites= 15 E= 0 0.000000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 0.133333 0.000000 0.866667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0173.1 CG11617: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.058824 0.000000 0.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.588235 0.000000 0.176471 0.235294 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 >letter-probability matrix MA0176.1 CG15696-RA: alength= 4 w= 7 nsites= 32 E= 0 0.062500 0.093750 0.093750 0.750000 0.062500 0.093750 0.000000 0.843750 0.656250 0.000000 0.187500 0.156250 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.062500 0.937500 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 >letter-probability matrix MA0177.1 CG18599: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0 0.160000 0.400000 0.040000 0.400000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.040000 0.320000 0.640000 0.920000 0.000000 0.080000 0.000000 >letter-probability matrix MA0178.1 CG32105: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.105263 0.210526 0.000000 0.684211 0.105263 0.000000 0.000000 0.894737 0.894737 0.000000 0.000000 0.105263 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.052632 0.947368 0.000000 0.000000 0.052632 0.947368 0.789474 0.000000 0.210526 0.000000 >letter-probability matrix MA0179.1 CG32532: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.086957 0.260870 0.086957 0.565217 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.086957 0.913043 0.521739 0.000000 0.434783 0.043478 >letter-probability matrix MA0444.1 CG34031: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0 0.000000 0.040000 0.040000 0.920000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.880000 0.000000 0.000000 0.120000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.080000 0.000000 0.000000 0.920000 0.280000 0.000000 0.040000 0.680000 0.120000 0.000000 0.880000 0.000000 >letter-probability matrix MA0182.1 CG4328-RA: alength= 4 w= 7 nsites= 30 E= 0 0.400000 0.066667 0.100000 0.433333 0.233333 0.033333 0.000000 0.733333 0.433333 0.000000 0.000000 0.566667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 >letter-probability matrix MA0184.1 CG9876: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.100000 0.450000 0.150000 0.300000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.900000 0.000000 0.000000 0.100000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 >letter-probability matrix MA1700.1 Clamp: alength= 4 w= 14 nsites= 2651 E= 0 0.125236 0.094304 0.712184 0.068276 0.403998 0.171633 0.142588 0.281780 0.071294 0.066013 0.821577 0.041117 0.268955 0.498680 0.133535 0.098831 0.027914 0.010939 0.955111 0.006035 0.946813 0.012071 0.016220 0.024896 0.023387 0.004149 0.966428 0.006035 0.122595 0.753678 0.065636 0.058091 0.011694 0.004527 0.980762 0.003018 0.924557 0.010562 0.058469 0.006413 0.026782 0.013580 0.949453 0.010185 0.768767 0.125236 0.044512 0.061486 0.088269 0.189363 0.571482 0.150886 0.471897 0.123350 0.362127 0.042625 >letter-probability matrix MA0530.1 cnc::maf-S: alength= 4 w= 15 nsites= 474 E= 0 0.299578 0.238397 0.335443 0.126582 0.717300 0.042194 0.240506 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.858650 0.097046 0.044304 0.000000 0.000000 0.616034 0.168776 0.215190 0.168776 0.000000 0.356540 0.474684 0.164557 0.453586 0.189873 0.191983 0.286920 0.069620 0.343882 0.299578 0.050633 0.000000 0.890295 0.059072 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.776371 0.000000 0.223629 0.000000 0.280591 0.270042 0.208861 0.240506 0.466245 0.132911 0.000000 0.400844 0.451477 0.025316 0.000000 0.523207 >letter-probability matrix MA0218.1 ct: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.300000 0.000000 0.700000 0.050000 0.100000 0.000000 0.850000 0.450000 0.000000 0.550000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.850000 0.000000 0.050000 0.100000 0.000000 0.950000 0.050000 0.000000 >letter-probability matrix MA0531.1 CTCF: alength= 4 w= 15 nsites= 1902 E= 0 0.160883 0.460568 0.211882 0.166667 0.164564 0.603049 0.115142 0.117245 0.240273 0.201367 0.434280 0.124080 0.355415 0.412198 0.184017 0.048370 0.135121 0.375394 0.045741 0.443743 0.806519 0.000526 0.100946 0.092008 0.106204 0.000000 0.893796 0.000000 0.518927 0.000000 0.479495 0.001577 0.001052 0.002103 0.163512 0.833333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001052 0.000000 0.868559 0.130389 0.065195 0.864879 0.001577 0.068349 0.000526 0.000000 0.950053 0.049422 0.041535 0.796004 0.004206 0.158254 0.121451 0.406414 0.075710 0.396425 >letter-probability matrix MA0445.1 D: alength= 4 w= 11 nsites= 29 E= 0 0.034483 0.275862 0.241379 0.448276 0.000000 0.862069 0.000000 0.137931 0.000000 0.586207 0.000000 0.413793 0.689655 0.000000 0.000000 0.310345 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.103448 0.896552 0.068966 0.000000 0.931034 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.034483 0.068966 0.137931 0.758621 0.137931 0.344828 0.206897 0.310345 0.206897 0.034483 0.034483 0.724138 >letter-probability matrix MA0174.1 Dbx: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.125000 0.000000 0.000000 0.875000 0.125000 0.000000 0.000000 0.875000 0.375000 0.000000 0.125000 0.500000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.125000 0.375000 0.500000 0.812500 0.000000 0.187500 0.000000 >letter-probability matrix MA0185.1 Deaf1: alength= 4 w= 6 nsites= 10 E= 0 0.000000 0.300000 0.000000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.500000 0.100000 0.300000 0.400000 0.200000 >letter-probability matrix MA0186.1 Dfd: alength= 4 w= 7 nsites= 24 E= 0 0.041667 0.166667 0.125000 0.666667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041667 0.000000 0.791667 0.166667 0.875000 0.000000 0.125000 0.000000 >letter-probability matrix MA0022.1 dl: alength= 4 w= 12 nsites= 13 E= 0 0.000000 0.384615 0.461538 0.153846 0.000000 0.000000 0.923077 0.076923 0.000000 0.076923 0.846154 0.076923 0.000000 0.000000 0.769231 0.230769 0.076923 0.076923 0.230769 0.615385 0.076923 0.000000 0.153846 0.769231 0.076923 0.000000 0.000000 0.923077 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.230769 0.000000 0.769231 0.076923 0.692308 0.000000 0.230769 0.076923 0.692308 0.076923 0.153846 0.230769 0.384615 0.384615 0.000000 >letter-probability matrix MA0023.1 dl_var.2: alength= 4 w= 10 nsites= 9 E= 0 0.000000 0.111111 0.777778 0.111111 0.000000 0.000000 0.777778 0.222222 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.888889 0.111111 0.444444 0.111111 0.000000 0.444444 0.222222 0.111111 0.000000 0.666667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.111111 0.888889 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0187.1 Dll: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.043478 0.000000 0.000000 0.956522 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.130435 0.000000 0.130435 0.739130 0.434783 0.000000 0.391304 0.173913 0.043478 0.521739 0.173913 0.260870 >letter-probability matrix MA1455.1 dmrt99B: alength= 4 w= 17 nsites= 999 E= 0 0.289289 0.150150 0.115115 0.445445 0.224449 0.201403 0.142285 0.431864 0.092184 0.038076 0.809619 0.060120 0.341683 0.288577 0.009018 0.360721 0.348697 0.085170 0.039078 0.527054 0.980962 0.004008 0.008016 0.007014 0.010020 0.956914 0.010020 0.023046 0.857715 0.008016 0.010020 0.124248 0.934935 0.026026 0.039039 0.000000 0.137275 0.021042 0.011022 0.830661 0.041082 0.012024 0.934870 0.012024 0.003006 0.004008 0.002004 0.990982 0.619238 0.035070 0.066132 0.279559 0.356713 0.011022 0.260521 0.371743 0.063190 0.827482 0.027081 0.082247 0.479960 0.155311 0.200401 0.164329 0.530060 0.117234 0.128257 0.224449 >letter-probability matrix MA0188.1 Dr: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.619048 0.285714 0.047619 0.000000 0.761905 0.000000 0.238095 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA1456.1 Dref: alength= 4 w= 10 nsites= 3112 E= 0 0.261568 0.196658 0.351864 0.189910 0.254177 0.330334 0.114717 0.300771 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.117931 0.053342 0.039203 0.789524 0.586440 0.060411 0.147494 0.205656 >letter-probability matrix MA0915.1 dve: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.276000 0.379000 0.138000 0.207000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.971000 0.000000 0.029000 0.348000 0.217000 0.348000 0.087000 >letter-probability matrix MA0189.1 E5: alength= 4 w= 7 nsites= 43 E= 0 0.116279 0.348837 0.139535 0.395349 0.069767 0.000000 0.000000 0.930233 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.976744 0.000000 0.000000 0.023256 0.023256 0.000000 0.023256 0.953488 0.116279 0.000000 0.372093 0.511628 0.790698 0.000000 0.209302 0.000000 >letter-probability matrix MA0534.1 EcR::usp: alength= 4 w= 15 nsites= 104 E= 0 0.278846 0.346154 0.375000 0.000000 0.576923 0.115385 0.307692 0.000000 0.182692 0.096154 0.721154 0.000000 0.048077 0.028846 0.336538 0.586538 0.086538 0.000000 0.000000 0.913462 0.115385 0.634615 0.000000 0.250000 0.711538 0.000000 0.288462 0.000000 0.326923 0.105769 0.048077 0.519231 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.634615 0.317308 0.000000 0.048077 0.471154 0.528846 0.000000 0.000000 0.201923 0.548077 0.000000 0.250000 0.000000 0.326923 0.000000 0.673077 0.230769 0.269231 0.000000 0.500000 >letter-probability matrix MA0026.1 Eip74EF: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.117647 0.705882 0.117647 0.058824 0.294118 0.705882 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.294118 0.058824 0.588235 0.058824 >letter-probability matrix MA0219.1 ems: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.350000 0.050000 0.450000 0.150000 0.000000 0.000000 0.850000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.500000 0.450000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 >letter-probability matrix MA0220.1 en: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.086957 0.347826 0.086957 0.478261 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.086957 0.913043 0.565217 0.000000 0.434783 0.000000 >letter-probability matrix MA0916.1 Ets21C: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.001001 0.996997 0.001001 0.001001 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.897000 0.001000 0.001000 0.101000 0.333000 0.001000 0.665000 0.001000 0.001000 0.286000 0.001000 0.712000 >letter-probability matrix MA0221.1 eve: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.136364 0.454545 0.000000 0.409091 0.045455 0.000000 0.000000 0.954545 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.090909 0.045455 0.863636 0.000000 0.090909 0.500000 0.409091 0.772727 0.000000 0.181818 0.045455 >letter-probability matrix MA0222.1 exd: alength= 4 w= 8 nsites= 17 E= 0 0.235294 0.235294 0.235294 0.294118 0.058824 0.000000 0.117647 0.823529 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.705882 0.000000 0.294118 0.647059 0.000000 0.352941 0.000000 >letter-probability matrix MA0224.1 exex: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.304348 0.434783 0.260870 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.043478 0.043478 0.000000 0.913043 0.869565 0.000000 0.130435 0.000000 >letter-probability matrix MA0446.1 fkh: alength= 4 w= 11 nsites= 27 E= 0 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.185185 0.000000 0.814815 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 0.481481 0.000000 0.518519 0.000000 0.148148 0.481481 0.074074 0.296296 0.222222 0.259259 0.111111 0.407407 0.000000 0.407407 0.074074 0.518519 0.851852 0.000000 0.037037 0.111111 0.555556 0.148148 0.148148 0.148148 >letter-probability matrix MA0225.1 ftz: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.055556 0.111111 0.000000 0.833333 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.500000 0.777778 0.000000 0.222222 0.000000 >letter-probability matrix MA0917.1 gcm2: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.730000 0.111000 0.159000 0.000000 0.000000 0.012000 0.000000 0.988000 0.235000 0.024000 0.741000 0.000000 0.047000 0.800000 0.141000 0.012000 0.070929 0.000000 0.752248 0.176823 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.055944 0.351648 0.092907 0.499500 >letter-probability matrix MA1457.1 grh: alength= 4 w= 13 nsites= 3332 E= 0 0.351140 0.219088 0.265006 0.164766 0.574730 0.143157 0.160564 0.121549 0.927371 0.008103 0.026711 0.037815 0.963685 0.006002 0.017107 0.013205 0.008703 0.979892 0.005402 0.006002 0.056122 0.847839 0.059724 0.036315 0.574430 0.058223 0.251501 0.115846 0.006002 0.017107 0.966687 0.010204 0.014706 0.010204 0.006903 0.968187 0.017407 0.028812 0.006903 0.946879 0.107443 0.170768 0.122149 0.599640 0.163866 0.235894 0.245498 0.354742 0.226291 0.280012 0.234994 0.258703 >letter-probability matrix MA0190.1 Gsc: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.090909 0.272727 >letter-probability matrix MA0447.1 gt: alength= 4 w= 10 nsites= 60 E= 0 0.466667 0.083333 0.416667 0.033333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.016667 0.016667 0.050000 0.916667 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 0.000000 0.883333 0.000000 0.116667 0.116667 0.000000 0.883333 0.000000 0.000000 0.100000 0.000000 0.900000 0.916667 0.050000 0.016667 0.016667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.033333 0.416667 0.083333 0.466667 >letter-probability matrix MA0449.1 h: alength= 4 w= 10 nsites= 34 E= 0 0.029412 0.058824 0.882353 0.029412 0.088235 0.205882 0.500000 0.205882 0.029412 0.911765 0.029412 0.029412 0.647059 0.029412 0.294118 0.029412 0.029412 0.882353 0.029412 0.058824 0.058824 0.029412 0.882353 0.029412 0.029412 0.294118 0.029412 0.647059 0.029412 0.029412 0.911765 0.029412 0.205882 0.500000 0.205882 0.088235 0.029412 0.882353 0.058824 0.029412 >letter-probability matrix MA0448.1 H2.0: alength= 4 w= 7 nsites= 32 E= 0 0.187500 0.093750 0.125000 0.593750 0.062500 0.031250 0.000000 0.906250 0.500000 0.031250 0.031250 0.437500 0.968750 0.000000 0.000000 0.031250 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.250000 0.000000 0.281250 0.468750 0.750000 0.000000 0.218750 0.031250 >letter-probability matrix MA0049.1 hb: alength= 4 w= 10 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.312500 0.500000 0.125000 0.375000 0.500000 0.125000 0.000000 0.562500 0.187500 0.250000 0.000000 0.250000 0.187500 0.062500 0.500000 0.812500 0.062500 0.000000 0.125000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.875000 0.000000 0.125000 0.000000 0.937500 0.062500 0.000000 0.000000 0.562500 0.125000 0.125000 0.187500 >letter-probability matrix MA0226.1 hbn: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.117647 0.117647 0.117647 0.647059 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.529412 0.000000 0.411765 0.058824 >letter-probability matrix MA0191.1 HGTX: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.200000 0.100000 0.150000 0.550000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.050000 0.000000 0.300000 0.650000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 >letter-probability matrix MA0183.1 HHEX: alength= 4 w= 8 nsites= 26 E= 0 0.269231 0.115385 0.076923 0.538462 0.000000 0.269231 0.000000 0.730769 0.000000 0.230769 0.269231 0.500000 0.807692 0.000000 0.076923 0.115385 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.115385 0.115385 0.769231 0.269231 0.000000 0.038462 0.692308 0.846154 0.000000 0.153846 0.000000 >letter-probability matrix MA0450.1 hkb: alength= 4 w= 9 nsites= 32 E= 0 0.093750 0.000000 0.562500 0.343750 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.093750 0.906250 0.000000 0.000000 0.968750 0.031250 0.750000 0.093750 0.062500 0.093750 >letter-probability matrix MA0192.1 Hmx: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.150000 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 >letter-probability matrix MA1458.1 Hsf: alength= 4 w= 12 nsites= 2122 E= 0 0.304901 0.172479 0.199340 0.323280 0.251178 0.209237 0.198398 0.341188 0.034873 0.026861 0.020264 0.918002 0.020264 0.017908 0.023091 0.938737 0.005184 0.975495 0.010368 0.008954 0.025448 0.611216 0.131480 0.231857 0.933553 0.024034 0.023091 0.019321 0.015551 0.017436 0.959472 0.007540 0.940622 0.031103 0.013666 0.014609 0.912347 0.019321 0.023563 0.044769 0.314797 0.211593 0.221018 0.252592 0.310085 0.208765 0.180961 0.300189 >letter-probability matrix MA0227.1 hth: alength= 4 w= 6 nsites= 17 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.823529 0.000000 0.176471 0.000000 0.000000 0.000000 0.666667 0.333333 >letter-probability matrix MA0228.1 ind: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.000000 0.571429 0.000000 0.428571 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.047619 0.952381 0.000000 0.000000 0.380952 0.619048 0.904762 0.000000 0.095238 0.000000 >letter-probability matrix MA0229.1 inv: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0 0.250000 0.000000 0.187500 0.562500 0.062500 0.562500 0.000000 0.375000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.687500 0.000000 0.312500 0.000000 >letter-probability matrix MA0451.1 kni: alength= 4 w= 12 nsites= 26 E= 0 0.730769 0.038462 0.076923 0.153846 0.961538 0.038462 0.000000 0.000000 0.615385 0.000000 0.000000 0.384615 0.192308 0.346154 0.230769 0.230769 0.000000 0.153846 0.038462 0.807692 0.807692 0.000000 0.192308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.653846 0.000000 0.307692 0.038462 0.038462 0.115385 0.692308 0.153846 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.961538 0.000000 0.038462 0.000000 0.192308 0.461538 0.269231 0.076923 >letter-probability matrix MA0452.2 Kr: alength= 4 w= 14 nsites= 1296 E= 0 0.138117 0.325617 0.183642 0.352623 0.158179 0.145833 0.168210 0.527778 0.116512 0.297840 0.056327 0.529321 0.962963 0.000000 0.000000 0.037037 0.833333 0.166667 0.000000 0.000000 0.008488 0.902778 0.000000 0.088735 0.000000 0.908179 0.000000 0.091821 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.155864 0.000000 0.844136 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.087191 0.000000 0.912809 0.087191 0.307870 0.178241 0.426698 0.245370 0.248457 0.219907 0.286265 0.162809 0.334877 0.168981 0.333333 >letter-probability matrix MA0230.1 lab: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.187500 0.000000 0.750000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 0.000000 0.000000 0.375000 0.625000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0231.1 lbe: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.454545 0.090909 0.409091 0.181818 0.227273 0.136364 0.454545 0.863636 0.000000 0.136364 0.000000 >letter-probability matrix MA0232.1 lbl: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.217391 0.000000 0.782609 0.043478 0.130435 0.304348 0.521739 0.739130 0.000000 0.260870 0.000000 >letter-probability matrix MA0194.1 Lim1: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 >letter-probability matrix MA0195.1 Lim3: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.350000 0.100000 0.400000 0.200000 0.000000 0.000000 0.800000 0.800000 0.000000 0.150000 0.050000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.100000 0.200000 0.700000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 >letter-probability matrix MA0175.1 lms: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.095238 0.333333 0.047619 0.523810 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.142857 0.000000 0.190476 0.666667 0.380952 0.000000 0.619048 0.000000 >letter-probability matrix MA1459.1 M1BP: alength= 4 w= 18 nsites= 1461 E= 0 0.254620 0.285421 0.299795 0.160164 0.308693 0.301848 0.296372 0.093087 0.234086 0.221081 0.141684 0.403149 0.464066 0.236824 0.212183 0.086927 0.036961 0.566051 0.036961 0.360027 0.024641 0.003422 0.966461 0.005476 0.004107 0.002053 0.978097 0.015743 0.001369 0.112936 0.041752 0.843943 0.047228 0.939083 0.003422 0.010267 0.945927 0.019849 0.011636 0.022587 0.000684 0.947296 0.002738 0.049281 0.895277 0.010267 0.012320 0.082136 0.000684 0.953457 0.001369 0.044490 0.039699 0.088980 0.008214 0.863107 0.199179 0.049281 0.642710 0.108830 0.260096 0.329227 0.204654 0.206023 0.249829 0.268309 0.193018 0.288843 0.251882 0.313484 0.208761 0.225873 >letter-probability matrix MA0535.1 Mad: alength= 4 w= 15 nsites= 102 E= 0 0.000000 0.470588 0.460784 0.068627 0.343137 0.254902 0.127451 0.274510 0.000000 0.137255 0.862745 0.000000 0.343137 0.000000 0.549020 0.107843 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.225490 0.637255 0.000000 0.137255 0.000000 0.696078 0.303922 0.000000 0.284314 0.000000 0.715686 0.000000 0.284314 0.382353 0.333333 0.000000 0.107843 0.519608 0.245098 0.127451 0.284314 0.000000 0.715686 0.000000 0.117647 0.470588 0.264706 0.147059 0.313725 0.333333 0.156863 0.196078 0.107843 0.274510 0.617647 0.000000 >letter-probability matrix MA0233.1 mirr: alength= 4 w= 5 nsites= 41 E= 0 0.487805 0.024390 0.024390 0.463415 0.707317 0.000000 0.048780 0.243902 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0196.1 NK7.1: alength= 4 w= 7 nsites= 35 E= 0 0.142857 0.142857 0.028571 0.685714 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.942857 0.000000 0.057143 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.114286 0.000000 0.142857 0.742857 0.171429 0.000000 0.200000 0.628571 0.371429 0.000000 0.628571 0.000000 >letter-probability matrix MA0197.2 nub: alength= 4 w= 12 nsites= 29 E= 0 0.068966 0.034483 0.034483 0.862069 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.862069 0.137931 0.000000 0.655172 0.034483 0.310345 0.827586 0.000000 0.000000 0.172414 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.137931 0.034483 0.000000 0.827586 0.206897 0.172414 0.275862 0.344828 0.655172 0.172414 0.034483 0.137931 0.137931 0.103448 0.517241 0.241379 >letter-probability matrix MA0234.1 oc: alength= 4 w= 6 nsites= 19 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.105263 0.894737 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.894737 0.052632 0.052632 >letter-probability matrix MA0454.1 odd: alength= 4 w= 11 nsites= 15 E= 0 0.466667 0.333333 0.000000 0.200000 0.666667 0.333333 0.000000 0.000000 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.733333 0.200000 0.066667 0.000000 0.333333 0.266667 0.400000 0.000000 >letter-probability matrix MA0198.1 OdsH: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.500000 0.181818 0.318182 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.590909 0.000000 0.363636 0.045455 >letter-probability matrix MA0235.1 onecut: alength= 4 w= 7 nsites= 15 E= 0 0.066667 0.133333 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.333333 0.000000 0.266667 0.400000 >letter-probability matrix MA0456.1 opa: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.055556 0.833333 0.111111 0.555556 0.388889 0.055556 0.000000 0.055556 0.888889 0.000000 0.055556 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 0.000000 0.888889 0.055556 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.777778 0.000000 0.222222 0.222222 0.000000 0.722222 0.055556 0.000000 0.777778 0.111111 0.111111 0.166667 0.055556 0.222222 0.555556 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 >letter-probability matrix MA0199.1 Optix: alength= 4 w= 5 nsites= 27 E= 0 0.000000 0.185185 0.000000 0.814815 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.962963 0.000000 0.037037 0.000000 >letter-probability matrix MA0236.1 otp: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.300000 0.100000 0.550000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.200000 0.750000 0.750000 0.000000 0.150000 0.100000 >letter-probability matrix MA0126.1 ovo: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0 0.476190 0.190476 0.000000 0.333333 0.047619 0.190476 0.666667 0.095238 0.190476 0.095238 0.095238 0.619048 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.238095 0.142857 0.285714 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.238095 0.190476 0.095238 0.476190 >letter-probability matrix MA0237.2 pan: alength= 4 w= 14 nsites= 71 E= 0 0.000000 0.000000 0.478873 0.521127 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.281690 0.563380 0.154930 0.098592 0.605634 0.042254 0.253521 0.154930 0.140845 0.267606 0.436620 0.098592 0.563380 0.000000 0.338028 0.000000 0.422535 0.211268 0.366197 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.154930 0.845070 0.154930 0.126761 0.577465 0.140845 0.478873 0.000000 0.295775 0.225352 0.309859 0.000000 0.000000 0.690141 >letter-probability matrix MA0238.1 pb: alength= 4 w= 7 nsites= 24 E= 0 0.166667 0.375000 0.000000 0.458333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.458333 0.541667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA1702.1 Pdp1: alength= 4 w= 12 nsites= 4816 E= 0 0.304817 0.157600 0.236919 0.300664 0.383721 0.158846 0.282807 0.174626 0.026163 0.009551 0.013289 0.950997 0.022841 0.010174 0.024709 0.942276 0.927741 0.007267 0.045266 0.019726 0.022633 0.070598 0.015365 0.891404 0.068729 0.015781 0.876453 0.039037 0.031977 0.681478 0.016404 0.270141 0.954734 0.018272 0.014743 0.012251 0.956395 0.012458 0.014120 0.017027 0.189784 0.262251 0.144103 0.403862 0.292151 0.245640 0.166528 0.295681 >letter-probability matrix MA0457.1 PHDP: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.235294 0.352941 0.000000 0.411765 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.058824 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058824 0.000000 0.058824 0.882353 0.470588 0.058824 0.235294 0.235294 >letter-probability matrix MA1460.1 pho: alength= 4 w= 11 nsites= 6951 E= 0 0.329881 0.250036 0.183571 0.236513 0.324558 0.170047 0.294922 0.210473 0.890663 0.042728 0.038556 0.028054 0.014962 0.022155 0.017839 0.945044 0.020573 0.045749 0.906776 0.026903 0.016688 0.021580 0.937419 0.024313 0.043015 0.874694 0.039419 0.042872 0.048914 0.753273 0.132787 0.065027 0.071644 0.025752 0.862466 0.040138 0.268451 0.346137 0.177672 0.207740 0.190620 0.361243 0.215796 0.232341 >letter-probability matrix MA0536.1 pnr: alength= 4 w= 11 nsites= 869 E= 0 0.094361 0.207135 0.005754 0.692750 0.922900 0.000000 0.000000 0.077100 0.000000 0.036824 0.001151 0.962025 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.667434 0.000000 0.100115 0.232451 0.141542 0.000000 0.609896 0.248562 0.066743 0.319908 0.223245 0.390104 0.104718 0.314154 0.126582 0.454545 >letter-probability matrix MA0200.1 Pph13: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.380952 0.142857 0.190476 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.619048 0.047619 0.285714 0.047619 >letter-probability matrix MA0239.1 prd: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0 0.476190 0.190476 0.000000 0.333333 0.047619 0.190476 0.666667 0.095238 0.190476 0.095238 0.095238 0.619048 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.238095 0.142857 0.285714 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.238095 0.190476 0.095238 0.476190 >letter-probability matrix MA0201.1 Ptx1: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.250000 0.050000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 >letter-probability matrix MA0240.1 repo: alength= 4 w= 7 nsites= 28 E= 0 0.035714 0.142857 0.142857 0.678571 0.035714 0.000000 0.000000 0.964286 0.964286 0.000000 0.000000 0.035714 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 >letter-probability matrix MA0241.1 ro: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 0.043478 0.521739 0.130435 0.304348 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.130435 0.869565 0.826087 0.000000 0.173913 0.000000 >letter-probability matrix MA0202.1 Rx: alength= 4 w= 7 nsites= 27 E= 0 0.111111 0.481481 0.000000 0.407407 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.629630 0.000000 0.370370 0.000000 >letter-probability matrix MA0193.1 schlank: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.473684 0.000000 0.526316 0.894737 0.105263 0.000000 0.000000 0.052632 0.947368 0.000000 0.000000 0.000000 0.631579 0.000000 0.368421 0.947368 0.000000 0.052632 0.000000 0.631579 0.000000 0.210526 0.157895 >letter-probability matrix MA0203.1 Scr: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0 0.120000 0.280000 0.000000 0.600000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.720000 0.280000 0.920000 0.000000 0.080000 0.000000 >letter-probability matrix MA0243.1 sd: alength= 4 w= 12 nsites= 14 E= 0 0.214286 0.000000 0.571429 0.214286 0.571429 0.071429 0.071429 0.285714 0.285714 0.571429 0.071429 0.071429 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.071429 0.071429 0.000000 0.857143 0.214286 0.000000 0.071429 0.714286 0.000000 0.571429 0.000000 0.428571 0.214286 0.357143 0.214286 0.214286 0.285714 0.071429 0.142857 0.500000 0.357143 0.428571 0.214286 0.000000 0.357143 0.071429 0.500000 0.071429 0.285714 0.214286 0.285714 0.214286 >letter-probability matrix MA0204.1 Six4: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.350000 0.200000 0.450000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0244.1 slbo: alength= 4 w= 8 nsites= 12 E= 0 0.750000 0.083333 0.083333 0.083333 0.000000 0.083333 0.000000 0.916667 0.000000 0.000000 0.250000 0.750000 0.250000 0.166667 0.583333 0.000000 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.583333 0.166667 0.166667 0.083333 0.500000 0.416667 0.083333 0.000000 0.916667 0.083333 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0245.1 slou: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.136364 0.227273 0.045455 0.590909 0.000000 0.045455 0.000000 0.954545 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.954545 0.000000 0.045455 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.045455 0.227273 0.636364 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 >letter-probability matrix MA0458.1 slp1: alength= 4 w= 11 nsites= 41 E= 0 0.195122 0.073171 0.341463 0.390244 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.073171 0.000000 0.926829 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.024390 0.975610 0.000000 0.000000 0.048780 0.951220 0.658537 0.000000 0.097561 0.243902 0.024390 0.536585 0.170732 0.268293 0.414634 0.195122 0.365854 0.024390 0.097561 0.317073 0.073171 0.512195 0.365854 0.073171 0.097561 0.463415 >letter-probability matrix MA0086.2 sna: alength= 4 w= 13 nsites= 1000 E= 0 0.241000 0.200000 0.309000 0.250000 0.128000 0.324000 0.264000 0.284000 0.454000 0.057000 0.387000 0.102000 0.835000 0.007000 0.114000 0.044000 0.005000 0.984000 0.006000 0.005000 0.984000 0.004000 0.007000 0.005000 0.087000 0.004000 0.903000 0.006000 0.005000 0.004000 0.986000 0.005000 0.005000 0.004000 0.007000 0.984000 0.009990 0.004995 0.975025 0.009990 0.042000 0.455000 0.184000 0.319000 0.535000 0.139000 0.147000 0.179000 0.290000 0.244000 0.230000 0.236000 >letter-probability matrix MA0246.1 so: alength= 4 w= 6 nsites= 27 E= 0 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.769231 0.000000 0.230769 >letter-probability matrix MA0532.1 Stat92E: alength= 4 w= 15 nsites= 118 E= 0 0.127119 0.423729 0.203390 0.245763 0.203390 0.186441 0.500000 0.110169 0.228814 0.296610 0.347458 0.127119 0.771186 0.008475 0.144068 0.076271 0.398305 0.000000 0.228814 0.372881 0.000000 0.008475 0.008475 0.983051 0.000000 0.050847 0.000000 0.949153 0.000000 0.898305 0.000000 0.101695 0.000000 0.567797 0.118644 0.313559 0.322034 0.177966 0.254237 0.245763 0.347458 0.016949 0.593220 0.042373 0.000000 0.008475 0.991525 0.000000 0.957627 0.000000 0.016949 0.025424 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.533898 0.076271 0.084746 0.305085 >letter-probability matrix MA0085.1 Su_H: alength= 4 w= 16 nsites= 10 E= 0 0.100000 0.300000 0.300000 0.300000 0.000000 0.400000 0.000000 0.600000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.300000 0.000000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.500000 0.500000 0.000000 0.000000 0.100000 0.700000 0.100000 0.100000 0.100000 0.200000 0.400000 0.300000 0.400000 0.200000 0.200000 0.200000 0.300000 0.100000 0.400000 0.200000 0.400000 0.300000 0.200000 0.100000 0.200000 0.100000 0.200000 0.500000 >letter-probability matrix MA0533.1 su_Hw: alength= 4 w= 21 nsites= 4737 E= 0 0.070931 0.239181 0.592780 0.097108 0.051298 0.868904 0.007389 0.072409 0.164239 0.633523 0.048765 0.153473 0.180494 0.312434 0.206249 0.300823 0.584125 0.123707 0.195271 0.096897 0.725776 0.043910 0.111674 0.118640 0.890226 0.019633 0.062276 0.027866 0.824150 0.004011 0.066709 0.105130 0.086553 0.049609 0.793540 0.070298 0.003589 0.093097 0.020266 0.883048 0.902681 0.004433 0.020055 0.072831 0.001478 0.002322 0.240659 0.755541 0.042010 0.001056 0.955457 0.001478 0.024488 0.969812 0.001267 0.004433 0.595525 0.086764 0.001689 0.316023 0.716065 0.062487 0.150517 0.070931 0.110407 0.512983 0.040321 0.336289 0.535149 0.074731 0.297446 0.092675 0.383154 0.271058 0.162550 0.183238 0.470973 0.094364 0.072831 0.361832 0.421364 0.080008 0.074098 0.424530 >letter-probability matrix MA1461.1 sv: alength= 4 w= 17 nsites= 998 E= 0 0.187375 0.314629 0.238477 0.259519 0.002004 0.273547 0.444890 0.279559 0.058116 0.735471 0.004008 0.202405 0.645938 0.015045 0.312939 0.026078 0.152305 0.284569 0.383768 0.179359 0.001002 0.323647 0.005010 0.670341 0.002002 0.640641 0.356356 0.001001 0.934935 0.002002 0.059059 0.004004 0.375752 0.029058 0.068136 0.527054 0.001001 0.129129 0.868869 0.001001 0.001002 0.983968 0.003006 0.012024 0.106212 0.001002 0.891784 0.001002 0.004012 0.002006 0.008024 0.985958 0.128257 0.001002 0.869739 0.001002 0.946894 0.002004 0.013026 0.038076 0.025025 0.971972 0.002002 0.001001 0.071142 0.213427 0.670341 0.045090 >letter-probability matrix MA0247.2 tin: alength= 4 w= 10 nsites= 515 E= 0 0.264078 0.104854 0.155340 0.475728 0.000000 0.365049 0.266019 0.368932 0.000000 0.099029 0.000000 0.900971 0.000000 0.825243 0.066019 0.108738 0.633010 0.000000 0.366990 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.025243 0.304854 0.584466 0.085437 >letter-probability matrix MA0459.1 tll: alength= 4 w= 10 nsites= 33 E= 0 0.606061 0.121212 0.121212 0.151515 0.878788 0.000000 0.121212 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.030303 0.030303 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.060606 0.000000 0.939394 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.000000 0.030303 0.030303 0.515152 0.303030 0.060606 0.121212 >letter-probability matrix MA0205.2 Trl: alength= 4 w= 12 nsites= 6858 E= 0 0.322251 0.193934 0.391805 0.092009 0.381744 0.196559 0.287547 0.134150 0.598863 0.087052 0.277340 0.036745 0.964275 0.006853 0.006416 0.022456 0.013269 0.007874 0.952902 0.025955 0.983231 0.003062 0.006416 0.007291 0.001458 0.005541 0.989064 0.003937 0.962817 0.026538 0.006562 0.004083 0.020560 0.004229 0.967921 0.007291 0.744386 0.123214 0.072178 0.060222 0.275299 0.090551 0.554097 0.080052 0.435112 0.126859 0.317731 0.120297 >letter-probability matrix MA0460.1 ttk: alength= 4 w= 9 nsites= 22 E= 0 0.454545 0.363636 0.136364 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.227273 0.000000 0.772727 0.954545 0.000000 0.000000 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.227273 0.136364 0.590909 >letter-probability matrix MA0248.1 tup: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.250000 0.125000 0.062500 0.562500 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.125000 0.875000 0.062500 0.000000 0.437500 0.500000 0.125000 0.000000 0.812500 0.062500 >letter-probability matrix MA0249.2 twi: alength= 4 w= 11 nsites= 2896 E= 0 0.364641 0.179213 0.276588 0.179558 0.239641 0.277970 0.184392 0.297997 0.891920 0.057320 0.023826 0.026934 0.005180 0.968232 0.008287 0.018301 0.982044 0.008978 0.003798 0.005180 0.005525 0.699240 0.053177 0.242058 0.940262 0.019682 0.028660 0.011395 0.010704 0.023826 0.015884 0.949586 0.047307 0.018646 0.922307 0.011740 0.105318 0.179213 0.208564 0.506906 0.320097 0.203039 0.247928 0.228936 >letter-probability matrix MA0094.2 Ubx: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.250000 0.150000 0.450000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 >letter-probability matrix MA0250.1 unc-4: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.238095 0.095238 0.619048 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.285714 0.047619 0.666667 0.000000 >letter-probability matrix MA0251.1 unpg: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.285714 0.190476 0.476190 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.095238 0.904762 0.666667 0.000000 0.333333 0.000000 >letter-probability matrix MA0016.1 usp: alength= 4 w= 10 nsites= 38 E= 0 0.000000 0.026316 0.973684 0.000000 0.026316 0.000000 0.947368 0.026316 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.947368 0.026316 0.026316 0.921053 0.000000 0.078947 0.000000 0.131579 0.657895 0.078947 0.131579 0.131579 0.210526 0.578947 0.078947 0.157895 0.263158 0.421053 0.157895 >letter-probability matrix MA1462.1 vfl: alength= 4 w= 12 nsites= 11731 E= 0 0.253857 0.264854 0.231182 0.250107 0.249339 0.235018 0.233569 0.282073 0.194613 0.166482 0.442673 0.196232 0.004433 0.909385 0.015344 0.070838 0.974768 0.002387 0.013895 0.008951 0.003666 0.004944 0.989003 0.002387 0.007757 0.004518 0.984145 0.003580 0.007928 0.058733 0.003154 0.930185 0.976899 0.010656 0.008013 0.004433 0.182678 0.148836 0.585031 0.083454 0.278749 0.244480 0.282073 0.194698 0.269116 0.270139 0.201517 0.259228 >letter-probability matrix MA0252.1 vis: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.125000 0.250000 0.500000 0.125000 >letter-probability matrix MA0253.1 vnd: alength= 4 w= 9 nsites= 19 E= 0 0.210526 0.000000 0.105263 0.684211 0.052632 0.421053 0.052632 0.473684 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.789474 0.105263 0.105263 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.105263 0.000000 0.000000 0.894737 0.473684 0.000000 0.526316 0.000000 >letter-probability matrix MA0181.1 Vsx1: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.045455 0.363636 0.045455 0.545455 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.000000 0.136364 0.772727 0.681818 0.000000 0.272727 0.045455 >letter-probability matrix MA0180.1 Vsx2: alength= 4 w= 9 nsites= 13 E= 0 0.076923 0.076923 0.384615 0.461538 0.153846 0.153846 0.000000 0.692308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.769231 0.000000 0.230769 0.000000 0.076923 0.153846 0.769231 0.000000 >letter-probability matrix MA0254.1 vvl: alength= 4 w= 6 nsites= 11 E= 0 0.000000 0.181818 0.000000 0.818182 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.181818 0.181818 0.000000 0.636364 0.000000 0.000000 0.545455 0.454545 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0255.1 z: alength= 4 w= 10 nsites= 41 E= 0 0.268293 0.073171 0.121951 0.536585 0.024390 0.170732 0.073171 0.731707 0.024390 0.000000 0.975610 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.024390 0.000000 0.975610 0.000000 0.195122 0.243902 0.000000 0.560976 0.048780 0.146341 0.707317 0.097561 0.439024 0.170732 0.268293 0.121951 0.243902 0.121951 0.292683 0.341463 0.341463 0.146341 0.048780 0.463415 >letter-probability matrix MA0256.1 zen: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.125000 0.562500 0.000000 0.312500 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.687500 0.312500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 >letter-probability matrix MA0257.1 zen2: alength= 4 w= 7 nsites= 26 E= 0 0.115385 0.269231 0.192308 0.423077 0.038462 0.000000 0.000000 0.961538 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.038462 0.000000 0.961538 0.000000 0.000000 0.384615 0.615385 0.846154 0.000000 0.153846 0.000000