Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
POU4F1_cluster
(id = 150)
General information about the entry
Representative name:
POU4F1_cluster
Position:
chr13:78814060-79843756
# UCNEs:
25
Assiciated genes:
EDNRB
;
POU4F1
;
RBM26
;
RNF219
;
Possible target genes:
POU4F1
;
UCNEs forming the cluster:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Sebastian
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Paralogous cluster(s):
POU4F2_cluster
;
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr1:157854908-157262290
Associated genes:
EDNRB
;
NDFIP2
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr14:104145568-105070718
# UCNEs:
25
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Sebastian
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr7:138927950-140206501
# UCNEs:
25
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Sebastian
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Contig12392:9359-9641
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Vanessa
;
Subcluster #2
Position:
Contig16632:4273-4490
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Sebastian
;
Subcluster #3
Position:
Contig4528:14166-29513
# UCNEs:
3
UCNEs:
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
Subcluster #4
Position:
Ultra230:14169-14511
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
Subcluster #5
Position:
Ultra290:4840-423743
# UCNEs:
15
UCNEs:
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
Subcluster #6
Position:
Ultra399:20512-209954
# UCNEs:
4
UCNEs:
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Violet
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr1:70628688-71174509
# UCNEs:
25
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Sebastian
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr3:97145485-97876857
# UCNEs:
24
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_AAWZ02040931:4616-4833
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Sebastian
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584465:238519-1146781
# UCNEs:
22
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172649:1070288-1467026
# UCNEs:
25
UCNEs:
POU4F1_Adam
;
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Chen
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Faust
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Gwyneth
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Lucifer
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Mignon
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Noah
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Scout
;
POU4F1_Sebastian
;
POU4F1_Silvester
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
POU4F1_Violet
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:4650883-4701728
# UCNEs:
9
UCNEs:
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr3:13254757-13335130
# UCNEs:
8
UCNEs:
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrII:6525162-6588777
# UCNEs:
11
UCNEs:
POU4F1_Alice
;
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Griselda
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
Subcluster #2
Position:
chrIX:6772158-6772305
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Lily
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr5:9198152-9239223
# UCNEs:
6
UCNEs:
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Naoko
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:101875968-101876117
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Boris
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_random:104235045-104235243
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Andrew
;
Subcluster #4
Position:
chrUn_random:107203377-107203559
# UCNEs:
1
UCNEs:
POU4F1_Andrew
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr6:4285789-4521025
# UCNEs:
11
UCNEs:
POU4F1_Andrew
;
POU4F1_Boris
;
POU4F1_Dorian
;
POU4F1_Eduardo
;
POU4F1_Helen
;
POU4F1_Laura
;
POU4F1_Lily
;
POU4F1_Midori
;
POU4F1_Poseidon
;
POU4F1_Tatiana
;
POU4F1_Vanessa
;