Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
NPAS3_cluster
(id = 163)
General information about the entry
Representative name:
NPAS3_cluster
Position:
chr14:33068679-34779105
# UCNEs:
71
Assiciated genes:
AKAP6
;
EGLN3
;
NPAS3
;
SPTSSA
;
Possible target genes:
NPAS3
;
UCNEs forming the cluster:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr5:37263221-38250721
Associated genes:
COCH
;
EAPP
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr12:52937233-54554218
# UCNEs:
71
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr1:204061063-204134834
# UCNEs:
2
UCNEs:
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Subcluster #2
Position:
chr1:204801512-206381929
# UCNEs:
69
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
chr4:24073095-25125286
# UCNEs:
70
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_William
;
Subcluster #2
Position:
Contig18514:5830-6086
# UCNEs:
1
UCNEs:
NPAS3_Violet
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr5:34779936-35775758
# UCNEs:
71
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr2:54825304-56215475
# UCNEs:
68
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_AAWZ02037110:8577-12962
# UCNEs:
2
UCNEs:
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584491:1008296-2479230
# UCNEs:
69
UCNEs:
NPAS3_Abraham
;
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Adam
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Antonio
;
NPAS3_Apollo
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Aurore
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Cameron
;
NPAS3_Cassandra
;
NPAS3_Claudia
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Demian
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Eduardo
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Flora
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Hamlet
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Jacob
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kaori
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucifer
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Megan
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Mustafa
;
NPAS3_Nagasawa
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Oskar
;
NPAS3_Othell
;
NPAS3_Patricia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Sam
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Theodore
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
NPAS3_Violet
;
NPAS3_William
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172673:527871-872828
# UCNEs:
29
UCNEs:
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Derek
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Frankenstein
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_1
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Leontina
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mateo
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Naomi
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Siddhartha
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:316663983-316729768
# UCNEs:
2
UCNEs:
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Evelyn
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:331596137-331629019
# UCNEs:
5
UCNEs:
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
Subcluster #3
Position:
chrUn:357621073-357622635
# UCNEs:
2
UCNEs:
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr22:23950145-24318714
# UCNEs:
9
UCNEs:
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrUn:55010888-55011126
# UCNEs:
1
UCNEs:
NPAS3_Lucy
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr10:13223859-13268643
# UCNEs:
3
UCNEs:
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Jan
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:54715238-54715300
# UCNEs:
1
UCNEs:
NPAS3_Trystan
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_random:78409774-78409955
# UCNEs:
1
UCNEs:
NPAS3_Ryan
;
Subcluster #4
Position:
chrUn_random:102605749-102605890
# UCNEs:
1
UCNEs:
NPAS3_Lucy
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr17:8937533-9741252
# UCNEs:
39
UCNEs:
NPAS3_Achilles
;
NPAS3_Agamemnon
;
NPAS3_Alexander
;
NPAS3_Amanda
;
NPAS3_Andrew
;
NPAS3_Antigone
;
NPAS3_Arthur
;
NPAS3_Beatrice
;
NPAS3_Daniel
;
NPAS3_Dominica
;
NPAS3_Doris
;
NPAS3_Emi
;
NPAS3_Evelyn
;
NPAS3_Faust
;
NPAS3_Gwyneth
;
NPAS3_Helen
;
NPAS3_Isolde
;
NPAS3_Jan
;
NPAS3_Jasmine
;
NPAS3_Jeremy_2
;
NPAS3_Joshua
;
NPAS3_Julia
;
NPAS3_Kazuki
;
NPAS3_Lily
;
NPAS3_Lucy
;
NPAS3_Mauritius
;
NPAS3_Mignon
;
NPAS3_Naoko
;
NPAS3_Olivia
;
NPAS3_Penelope
;
NPAS3_Poseidon
;
NPAS3_Robert
;
NPAS3_Ryan
;
NPAS3_Scout
;
NPAS3_Sebastian
;
NPAS3_Trevor
;
NPAS3_Trystan
;
NPAS3_Vera
;
NPAS3_Victor
;