Ultraconserved Genomic Regulatory Block: NPAS3_cluster
(id = 163)

General information about the entry
Representative name:NPAS3_cluster
Position:chr14:33068679-34779105
# UCNEs:71
Assiciated genes:AKAP6; EGLN3; NPAS3; SPTSSA;
Possible target genes:NPAS3;
UCNEs forming the cluster:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_Violet; NPAS3_William;
Paralogous cluster(s):

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Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr5:37263221-38250721
Associated genes: COCH; EAPP;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr12:52937233-54554218
# UCNEs:71
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_Violet; NPAS3_William;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr1:204061063-204134834
# UCNEs:2
UCNEs:NPAS3_Violet; NPAS3_William;
Subcluster #2

Position:

chr1:204801512-206381929
# UCNEs:69
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

chr4:24073095-25125286
# UCNEs:70
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_William;
Subcluster #2

Position:

Contig18514:5830-6086
# UCNEs:1
UCNEs:NPAS3_Violet;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr5:34779936-35775758
# UCNEs:71
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_Violet; NPAS3_William;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr2:54825304-56215475
# UCNEs:68
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_Violet; NPAS3_William;
Subcluster #2

Position:

chrUn_AAWZ02037110:8577-12962
# UCNEs:2
UCNEs:NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584491:1008296-2479230
# UCNEs:69
UCNEs:NPAS3_Abraham; NPAS3_Achilles; NPAS3_Adam; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Antonio; NPAS3_Apollo; NPAS3_Arthur; NPAS3_Aurore; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Cameron; NPAS3_Cassandra; NPAS3_Claudia; NPAS3_Daniel; NPAS3_Demian; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Eduardo; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Flora; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Hamlet; NPAS3_Helen; NPAS3_Jacob; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kaori; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucifer; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Megan; NPAS3_Mignon; NPAS3_Mustafa; NPAS3_Nagasawa; NPAS3_Naoko; NPAS3_Naomi; NPAS3_Olivia; NPAS3_Oskar; NPAS3_Othell; NPAS3_Patricia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Sam; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Theodore; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor; NPAS3_Violet; NPAS3_William;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172673:527871-872828
# UCNEs:29
UCNEs:NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Antigone; NPAS3_Daniel; NPAS3_Derek; NPAS3_Dominica; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Frankenstein; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_1; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Julia; NPAS3_Leontina; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mateo; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Naomi; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Ryan; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Siddhartha; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:316663983-316729768
# UCNEs:2
UCNEs:NPAS3_Alexander; NPAS3_Evelyn;
Subcluster #2

Position:

chrUn:331596137-331629019
# UCNEs:5
UCNEs:NPAS3_Lucy; NPAS3_Ryan; NPAS3_Scout; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera;
Subcluster #3

Position:

chrUn:357621073-357622635
# UCNEs:2
UCNEs:NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr22:23950145-24318714
# UCNEs:9
UCNEs:NPAS3_Alexander; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Ryan; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrUn:55010888-55011126
# UCNEs:1
UCNEs:NPAS3_Lucy;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr10:13223859-13268643
# UCNEs:3
UCNEs:NPAS3_Alexander; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Jan;
Subcluster #2

Position:

chrUn_random:54715238-54715300
# UCNEs:1
UCNEs:NPAS3_Trystan;
Subcluster #3

Position:

chrUn_random:78409774-78409955
# UCNEs:1
UCNEs:NPAS3_Ryan;
Subcluster #4

Position:

chrUn_random:102605749-102605890
# UCNEs:1
UCNEs:NPAS3_Lucy;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr17:8937533-9741252
# UCNEs:39
UCNEs:NPAS3_Achilles; NPAS3_Agamemnon; NPAS3_Alexander; NPAS3_Amanda; NPAS3_Andrew; NPAS3_Antigone; NPAS3_Arthur; NPAS3_Beatrice; NPAS3_Daniel; NPAS3_Dominica; NPAS3_Doris; NPAS3_Emi; NPAS3_Evelyn; NPAS3_Faust; NPAS3_Gwyneth; NPAS3_Helen; NPAS3_Isolde; NPAS3_Jan; NPAS3_Jasmine; NPAS3_Jeremy_2; NPAS3_Joshua; NPAS3_Julia; NPAS3_Kazuki; NPAS3_Lily; NPAS3_Lucy; NPAS3_Mauritius; NPAS3_Mignon; NPAS3_Naoko; NPAS3_Olivia; NPAS3_Penelope; NPAS3_Poseidon; NPAS3_Robert; NPAS3_Ryan; NPAS3_Scout; NPAS3_Sebastian; NPAS3_Trevor; NPAS3_Trystan; NPAS3_Vera; NPAS3_Victor;