Ultraconserved Genomic Regulatory Block: SMAD3_cluster
(id = 192)

General information about the entry
Representative name:SMAD3_cluster
Position:chr15:67199281-68080218
# UCNEs:21
Assiciated genes:AAGAB; C15orf61; IQCH; LOC100506686; MAP2K5; SMAD3; SMAD6;
Possible target genes:SMAD3; SMAD6;
UCNEs forming the cluster:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;
Paralogous cluster(s):SMAD2_cluster;

View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr10:20917286-21217027
Associated genes: MAP2K5; SMAD3; SMAD6;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr9:63176391-63881226
# UCNEs:21
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr1:153535419-153575833
# UCNEs:3
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian;
Subcluster #2

Position:

chr1:154216620-154721837
# UCNEs:18
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

Contig102:1119312-1830380
# UCNEs:20
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;
Subcluster #2

Position:

Contig35049:1062-1437
# UCNEs:1
UCNEs:SMAD3_Nick;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr10:19487594-19829020
# UCNEs:19
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chrUn_GL343467:267046-615145
# UCNEs:21
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584716:4931781-5610287
# UCNEs:21
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian; SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Vera; SMAD3_Xavier; SMAD3_Zeus;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172676:80068-202696
# UCNEs:16
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Naomi; SMAD3_Napoleon; SMAD3_Nick; SMAD3_Noah; SMAD3_Oberon; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Zeus;
Subcluster #2

Position:

GL172999:1132271-1139409
# UCNEs:3
UCNEs:SMAD3_Atsuko_1; SMAD3_Atsuko_2; SMAD3_Dorian;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:3440919-3476621
# UCNEs:7
UCNEs:SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Larisa; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Zeus;
Subcluster #2

Position:

chrUn:8561639-8599599
# UCNEs:11
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vera; SMAD3_Zeus;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr3:11064459-11132375
# UCNEs:9
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Zeus;
Subcluster #2

Position:

chr6:11229288-11286640
# UCNEs:10
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Zeus;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrII:18621821-18660346
# UCNEs:7
UCNEs:SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa;
Subcluster #2

Position:

chrXIX:6661346-6706737
# UCNEs:11
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vera; SMAD3_Zeus;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr13:8147309-8178387
# UCNEs:9
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Midori; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam;
Subcluster #2

Position:

chr5:10308916-10343671
# UCNEs:7
UCNEs:SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Larisa; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Vanessa; SMAD3_Zeus;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr18:19614225-19749936
# UCNEs:8
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Isolde; SMAD3_Larisa; SMAD3_Logan; SMAD3_Malcolm; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Zeus;
Subcluster #2

Position:

chr7:35316149-35431394
# UCNEs:6
UCNEs:SMAD3_Hannibal_1; SMAD3_Hannibal_2; SMAD3_Larisa; SMAD3_Robert; SMAD3_Sam; SMAD3_Zeus;