Ultraconserved Genomic Regulatory Block: IRXB_cluster
(id = 201)

General information about the entry
Representative name:IRXB_cluster
Position:chr16:50493248-55425289
# UCNEs:60
Assiciated genes:AKTIP; BRD7; CHD9; CRNDE; CYLD; FTO; IRX3; IRX5; IRX6; LOC100505619; LOC388276; LOC643714; LOC643802; MMP2; NKD1; NOD2; RBL2; RPGRIP1L; SALL1; SNX20; TOX3;
Possible target genes:IRX3; IRX5; IRX6; SALL1;
UCNEs forming the cluster:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Paralogous cluster(s):IRXA_cluster; SALL3_cluster;

View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr11:6769393-3824848
Associated genes: FTO; SALL1;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:
chr8:88447800-92743752
# UCNEs:60
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:
chr1:439549967-442710580
# UCNEs:28
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde;
Subcluster #2

Position:
chr1:443231055-445763282
# UCNEs:32
UCNEs:IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:
Contig217225:33-237
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Antonio;
Subcluster #2

Position:
Contig40306:650-927
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Molly;
Subcluster #3

Position:
Contig65:8502-2566956
# UCNEs:43
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon;
Subcluster #4

Position:
Ultra380:2865770-3577874
# UCNEs:14
UCNEs:IRXB_Roxane; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:
chr11:7608797-10295504
# UCNEs:60
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:
chrLGc:68686-2182805
# UCNEs:35
UCNEs:IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Subcluster #2

Position:
chrUn_AAWZ02036352:13769-14151
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Figaro;
Subcluster #3

Position:
chrUn_GL343227:10833-1601404
# UCNEs:24
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:
JH584557:1851580-6070279
# UCNEs:54
UCNEs:IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo; IRXB_Eros; IRXB_Figaro; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper; IRXB_Helen; IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Isolde; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Pandora; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Scarlett; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zhong;
Subcluster #2

Position:
JH584557:6579706-6579926
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Achilles;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:
GL172748:1341273-2259801
# UCNEs:16
UCNEs:IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Andrew; IRXB_Antigone; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Brooklyn; IRXB_Bryan_1; IRXB_Bryan_2; IRXB_Dorian; IRXB_Eden; IRXB_Eduardo;
Subcluster #2

Position:
GL172782:1841833-2212127
# UCNEs:9
UCNEs:IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Napoleon; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Penelope; IRXB_Poseidon; IRXB_Ruby;
Subcluster #3

Position:
GL172919:960061-1415866
# UCNEs:4
UCNEs:IRXB_Hong; IRXB_Isaac; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun;
Subcluster #4

Position:
GL172963:1272480-1299785
# UCNEs:5
UCNEs:IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Gabriel; IRXB_Hamlet; IRXB_Harper;
Subcluster #5

Position:
GL173094:317543-946381
# UCNEs:12
UCNEs:IRXB_Santiago; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Xavier; IRXB_Zeus; IRXB_Zhong;
Subcluster #6

Position:
GL173327:156807-156975
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Achilles;
Subcluster #7

Position:
GL174867:6837-7214
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Figaro;
Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:
chrUn:76206075-77163902
# UCNEs:37
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Eden; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Harper; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Zhong;
Subcluster #2

Position:
chrUn:178574211-178581754
# UCNEs:3
UCNEs:IRXB_Ruby; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Vivien;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:
chr3:28041560-29517136
# UCNEs:37
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Eden; IRXB_Eros; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Harper; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Oberon; IRXB_Pablo; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Zhong;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:
chrII:16869442-17919703
# UCNEs:41
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Antonio; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Bryan_2; IRXB_Eden; IRXB_Eros; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Harper; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Jonathan; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Pablo; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Zhong;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:
chr5:528541-1187901
# UCNEs:22
UCNEs:IRXB_Harper; IRXB_Isolde; IRXB_Jun; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Othell; IRXB_Poseidon; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Santiago; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien;
Subcluster #2

Position:
chrUn_random:36500078-36711086
# UCNEs:8
UCNEs:IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Eden;
Subcluster #3

Position:
chrUn_random:63213183-63213374
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Agamemnon;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:
chr25:37216824-37485434
# UCNEs:3
UCNEs:IRXB_Ruby; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien;
Subcluster #2

Position:
chr7:36945649-39061792
# UCNEs:35
UCNEs:IRXB_Achilles; IRXB_Adam; IRXB_Agamemnon; IRXB_Aida; IRXB_Alexander; IRXB_Apollo; IRXB_Ariel; IRXB_Ava; IRXB_Eden; IRXB_Flora_1; IRXB_Flora_2; IRXB_Harper; IRXB_Hong; IRXB_Isolde; IRXB_Jasmine; IRXB_Larisa; IRXB_Laura; IRXB_Leo; IRXB_Logan; IRXB_Lucifer; IRXB_Mateo; IRXB_Molly; IRXB_Oberon; IRXB_Othell; IRXB_Roxane; IRXB_Ruby; IRXB_Siddhartha_1; IRXB_Siddhartha_2; IRXB_Siddhartha_3; IRXB_Trevor; IRXB_Urania; IRXB_Vanessa; IRXB_Veronica; IRXB_Vivien; IRXB_Zhong;
Subcluster #3

Position:
Zv9_NA101:40341-40475
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Siddhartha_3;
Subcluster #4

Position:
Zv9_NA210:16093-16254
# UCNEs:1
UCNEs:IRXB_Oberon;