Ultraconserved Genomic Regulatory Block: NFIA_cluster
(id = 27)

General information about the entry
Representative name:NFIA_cluster
Position:chr1:60700474-62104266
# UCNEs:19
Assiciated genes:C1orf87; NFIA; TM2D1;
Possible target genes:NFIA;
UCNEs forming the cluster:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Franz; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;
Paralogous cluster(s):NFIB_cluster;

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Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr8:27567217-28077793
Associated genes: HOOK1; NFIA; USP1;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr4:96979874-98319114
# UCNEs:19
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Franz; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr2:29621299-31152182
# UCNEs:18
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Franz; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

Contig1152:3909-180827
# UCNEs:9
UCNEs:NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2;
Subcluster #2

Position:

Contig214514:360-637
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_William;
Subcluster #3

Position:

Contig22143:11644-11914
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Antonio;
Subcluster #4

Position:

Contig270148:171-516
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Naoko;
Subcluster #5

Position:

Contig3597:145-354
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Carmen;
Subcluster #6

Position:

Contig3832:32613-36151
# UCNEs:2
UCNEs:NFIA_Franz; NFIA_Laura;
Subcluster #7

Position:

Contig4913:22223-22517
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Xavier;
Subcluster #8

Position:

Contig9113:9583-9922
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Atsuko;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr8:24667067-25210535
# UCNEs:19
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Franz; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr4:100344026-101214137
# UCNEs:18
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584487:232301-1119068
# UCNEs:18
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Franz; NFIA_Laura; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172640:4190398-4699904
# UCNEs:18
UCNEs:NFIA_Abraham; NFIA_Antonio; NFIA_Atsuko; NFIA_Carmen; NFIA_Laura; NFIA_Leo; NFIA_Lukas; NFIA_Naoko; NFIA_Norma; NFIA_Olivia; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Quentin_2; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William; NFIA_Xavier;


Fugu (fr2):


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr18:11260877-11261087
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Atsuko;
Subcluster #2

Position:

chr4:6644525-6710591
# UCNEs:2
UCNEs:NFIA_Atsuko; NFIA_Leo;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrVII:6999697-6999910
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Atsuko;
Subcluster #2

Position:

chrVIII:977252-1121124
# UCNEs:7
UCNEs:NFIA_Atsuko; NFIA_Patricia; NFIA_Quentin_1; NFIA_Theodore; NFIA_Trystan_1; NFIA_Trystan_2; NFIA_William;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chrUn_random:81607045-81607292
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Theodore;
Subcluster #2

Position:

chrUn_random:97202382-97202636
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Atsuko;
Subcluster #3

Position:

chrUn_random:101759751-101759875
# UCNEs:1
UCNEs:NFIA_Atsuko;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr22:17015902-17274520
# UCNEs:6
UCNEs:NFIA_Atsuko; NFIA_Leo; NFIA_Norma; NFIA_Quentin_1; NFIA_Theodore; NFIA_Xavier;