Ultraconserved Genomic Regulatory Block: OTX1_cluster
(id = 287)

General information about the entry
Representative name:OTX1_cluster
Position:chr2:63014713-63662144
# UCNEs:16
Assiciated genes:DBIL5P2; EHBP1; LOC100132215; OTX1; WDPCP;
Possible target genes:OTX1;
UCNEs forming the cluster:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Paralogous cluster(s):OTX2_cluster;

View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr3:9149873-9361531
Associated genes: B3GNT2; MDH1;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:
chr11:21694041-22206768
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:
chr1:628945028-629535265
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:
Ultra56:4937325-5270887
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:
chr3:1170108-1410682
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:
chr1:120732795-121130543
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:
JH584519:607894-1031526
# UCNEs:14
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:
GL173109:629073-911065
# UCNEs:16
UCNEs:OTX1_Amos; OTX1_Boris; OTX1_Chen; OTX1_Eden; OTX1_Emi; OTX1_Figaro_1; OTX1_Figaro_2; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Mustafa; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:
chrUn:95759597-95784122
# UCNEs:5
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Veronica;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:
chr1:10539268-10616002
# UCNEs:7
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Ming; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;
Subcluster #2

Position:
chr15:11166295-11197211
# UCNEs:4
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:
chrIX:19055776-19069554
# UCNEs:4
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Ming; OTX1_Norma_2;
Subcluster #2

Position:
chrUn:60258319-60258584
# UCNEs:1
UCNEs:OTX1_Ming;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:
chr17:9933502-9957084
# UCNEs:5
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Veronica;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:
chr1:51416749-51416920
# UCNEs:1
UCNEs:OTX1_Veronica;
Subcluster #2

Position:
chr17:24068085-24218460
# UCNEs:9
UCNEs:OTX1_Chen; OTX1_Leontina; OTX1_Lucia; OTX1_Malcolm; OTX1_Ming; OTX1_Norma_1; OTX1_Norma_2; OTX1_Veronica; OTX1_Victor;