Ultraconserved Genomic Regulatory Block: LMO4_cluster
(id = 42)

General information about the entry
Representative name:LMO4_cluster
Position:chr1:87615911-88928077
# UCNEs:40
Assiciated genes:LMO4; LOC100505768; LOC339524; PKN2;
Possible target genes:LMO4;
UCNEs forming the cluster:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Paralogous cluster(s):

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Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr8:16519447-15985834
Associated genes: HS2ST1; LMO4;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr3:143101318-144382743
# UCNEs:40
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr2:39188752-41125901
# UCNEs:40
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

chr4:47925481-49330222
# UCNEs:39
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Subcluster #2

Position:

Contig6357:19761-20151
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Chao;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr8:11829449-12382357
# UCNEs:40
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr4:96115111-97166543
# UCNEs:40
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584690:458860-1178542
# UCNEs:38
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Aphrodite; LMO4_Brooklyn; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Olivia_2; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172721:2732521-3017614
# UCNEs:22
UCNEs:LMO4_Abraham; LMO4_Agamemnon; LMO4_Aida; LMO4_Akiko; LMO4_Amos; LMO4_Brooklyn; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Eugene; LMO4_Figaro; LMO4_Frederica; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hana; LMO4_Hannibal; LMO4_Jan; LMO4_Jasmine; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Julia;
Subcluster #2

Position:

GL173354:296312-503442
# UCNEs:14
UCNEs:LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Midori; LMO4_Norma; LMO4_Olivia_1; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Ursula; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:137281737-137410865
# UCNEs:17
UCNEs:LMO4_Akiko; LMO4_Bryan; LMO4_Dominica; LMO4_Eduardo; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Ruby; LMO4_Sam; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Subcluster #2

Position:

chrUn:179453228-179453501
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr4:5056246-5312662
# UCNEs:15
UCNEs:LMO4_Akiko; LMO4_Bryan; LMO4_Eduardo; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Sam; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Subcluster #2

Position:

scaffold6374:632-965
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrVIII:2765661-2905641
# UCNEs:18
UCNEs:LMO4_Akiko; LMO4_Bryan; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Sam; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Subcluster #2

Position:

chrXIII:382150-382445
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;
Subcluster #3

Position:

chrXIV:14555545-14555844
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr1:10007960-10096402
# UCNEs:9
UCNEs:LMO4_Frodo; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Ruby; LMO4_Trevor; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;
Subcluster #2

Position:

chrUn_random:57191055-57201453
# UCNEs:4
UCNEs:LMO4_Akiko; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Eduardo;
Subcluster #3

Position:

chrUn_random:95890548-95890765
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;
Subcluster #4

Position:

chrUn_random:104002578-104002768
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Bryan;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr2:23139057-23139286
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Akiko;
Subcluster #2

Position:

chr5:34574816-34575288
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;
Subcluster #3

Position:

chr6:25381261-25718815
# UCNEs:13
UCNEs:LMO4_Akiko; LMO4_Bryan; LMO4_Chao; LMO4_Dominica; LMO4_Dorian; LMO4_Eduardo; LMO4_Figaro; LMO4_Frodo; LMO4_Gwyneth; LMO4_Hannibal; LMO4_Jeremy; LMO4_Jonathan; LMO4_Leontina;
Subcluster #4

Position:

chr8:55027279-55027446
# UCNEs:1
UCNEs:LMO4_Frodo;
Subcluster #5

Position:

Zv9_scaffold3471:185031-588459
# UCNEs:10
UCNEs:LMO4_Leontina; LMO4_Lily; LMO4_Lukas; LMO4_Sam; LMO4_Santiago; LMO4_Scout; LMO4_Siddhartha; LMO4_Trevor; LMO4_Wagner; LMO4_Xavier;