Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
LMO4_cluster
(id = 42)
General information about the entry
Representative name:
LMO4_cluster
Position:
chr1:87615911-88928077
# UCNEs:
40
Assiciated genes:
LMO4
;
LOC100505768
;
LOC339524
;
PKN2
;
Possible target genes:
LMO4
;
UCNEs forming the cluster:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr8:16519447-15985834
Associated genes:
HS2ST1
;
LMO4
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr3:143101318-144382743
# UCNEs:
40
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr2:39188752-41125901
# UCNEs:
40
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
chr4:47925481-49330222
# UCNEs:
39
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
Contig6357:19761-20151
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Chao
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr8:11829449-12382357
# UCNEs:
40
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr4:96115111-97166543
# UCNEs:
40
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584690:458860-1178542
# UCNEs:
38
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Aphrodite
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Olivia_2
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172721:2732521-3017614
# UCNEs:
22
UCNEs:
LMO4_Abraham
;
LMO4_Agamemnon
;
LMO4_Aida
;
LMO4_Akiko
;
LMO4_Amos
;
LMO4_Brooklyn
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Eugene
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frederica
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hana
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jan
;
LMO4_Jasmine
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Julia
;
Subcluster #2
Position:
GL173354:296312-503442
# UCNEs:
14
UCNEs:
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Midori
;
LMO4_Norma
;
LMO4_Olivia_1
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Ursula
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:137281737-137410865
# UCNEs:
17
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:179453228-179453501
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr4:5056246-5312662
# UCNEs:
15
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
scaffold6374:632-965
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrVIII:2765661-2905641
# UCNEs:
18
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
chrXIII:382150-382445
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Subcluster #3
Position:
chrXIV:14555545-14555844
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr1:10007960-10096402
# UCNEs:
9
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Ruby
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:57191055-57201453
# UCNEs:
4
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Eduardo
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_random:95890548-95890765
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Subcluster #4
Position:
chrUn_random:104002578-104002768
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Bryan
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr2:23139057-23139286
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
Subcluster #2
Position:
chr5:34574816-34575288
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Subcluster #3
Position:
chr6:25381261-25718815
# UCNEs:
13
UCNEs:
LMO4_Akiko
;
LMO4_Bryan
;
LMO4_Chao
;
LMO4_Dominica
;
LMO4_Dorian
;
LMO4_Eduardo
;
LMO4_Figaro
;
LMO4_Frodo
;
LMO4_Gwyneth
;
LMO4_Hannibal
;
LMO4_Jeremy
;
LMO4_Jonathan
;
LMO4_Leontina
;
Subcluster #4
Position:
chr8:55027279-55027446
# UCNEs:
1
UCNEs:
LMO4_Frodo
;
Subcluster #5
Position:
Zv9_scaffold3471:185031-588459
# UCNEs:
10
UCNEs:
LMO4_Leontina
;
LMO4_Lily
;
LMO4_Lukas
;
LMO4_Sam
;
LMO4_Santiago
;
LMO4_Scout
;
LMO4_Siddhartha
;
LMO4_Trevor
;
LMO4_Wagner
;
LMO4_Xavier
;