Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
OTP_cluster
(id = 452)
General information about the entry
Representative name:
OTP_cluster
Position:
chr5:76856156-77514616
# UCNEs:
35
Assiciated genes:
AP3B1
;
OTP
;
TBCA
;
WDR41
;
Possible target genes:
OTP
;
UCNEs forming the cluster:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chrZ:22620916-22265838
Associated genes:
F2RL1
;
TBCA
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr13:94415287-94941964
# UCNEs:
35
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr3:38204970-38973197
# UCNEs:
34
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
chr1:16479516-16961683
# UCNEs:
33
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #2
Position:
Contig7564:9103-9483
# UCNEs:
1
UCNEs:
OTP_Jonathan
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chrZ:56395194-56731955
# UCNEs:
35
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr2:13422484-13919187
# UCNEs:
35
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584533:13335317-13879286
# UCNEs:
32
UCNEs:
OTP_Achilles
;
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Florentino
;
OTP_Franz
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucifer
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL173215:668195-674787
# UCNEs:
2
UCNEs:
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #2
Position:
GL173315:5726-224457
# UCNEs:
15
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Ava
;
OTP_Cameron
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lucifer
;
Subcluster #3
Position:
GL173817:12482-139592
# UCNEs:
14
UCNEs:
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Nick
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Pablo
;
OTP_Ruby
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Violet
;
Subcluster #4
Position:
GL174288:31368-31568
# UCNEs:
1
UCNEs:
OTP_Faust
;
Subcluster #5
Position:
GL177917:7193-7403
# UCNEs:
1
UCNEs:
OTP_Franz
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:17485352-17523358
# UCNEs:
14
UCNEs:
OTP_Derek
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Hans
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Scout
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Wagner
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:73744419-73807702
# UCNEs:
17
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Scout
;
OTP_Toru
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #3
Position:
chrUn:379655231-379655477
# UCNEs:
1
UCNEs:
OTP_Hans
;
Subcluster #4
Position:
chrUn:391999330-392002916
# UCNEs:
2
UCNEs:
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr12:2670156-2812449
# UCNEs:
16
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Scout
;
OTP_Toru
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #2
Position:
chr9:6160301-6212045
# UCNEs:
15
UCNEs:
OTP_Derek
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Scout
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Wagner
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrUn:49122770-49135319
# UCNEs:
3
UCNEs:
OTP_Scout
;
OTP_Toru
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #2
Position:
chrXIII:4488908-4537038
# UCNEs:
17
UCNEs:
OTP_Derek
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Hans
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Scout
;
OTP_Sebastian
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Wagner
;
Subcluster #3
Position:
chrXIV:917564-986207
# UCNEs:
8
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Ariel
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Toru
;
OTP_Zhong
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr12:3286257-3322805
# UCNEs:
15
UCNEs:
OTP_Derek
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Hans
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Pablo
;
OTP_Scout
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Wagner
;
Subcluster #2
Position:
chr4:4621119-4678090
# UCNEs:
17
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Scout
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Zhong
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr21:7446038-7542480
# UCNEs:
9
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Derek
;
OTP_Dorian
;
OTP_Elvira
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
Subcluster #2
Position:
chr5:53466490-53800957
# UCNEs:
19
UCNEs:
OTP_Akiko
;
OTP_Faust
;
OTP_Florentino
;
OTP_Frodo
;
OTP_Gwyneth
;
OTP_Hans
;
OTP_Haruki
;
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Mauritius
;
OTP_Olivia
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Oskar
;
OTP_Scout
;
OTP_Silvester
;
OTP_Toru
;
OTP_Wagner
;
OTP_Zhong
;
Subcluster #3
Position:
chr7:29216111-29381664
# UCNEs:
8
UCNEs:
OTP_Hector
;
OTP_Jonathan
;
OTP_Lincoln
;
OTP_Lucy
;
OTP_Lukas
;
OTP_Ophelia
;
OTP_Scout
;
OTP_Zhong
;