Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
BNC2_cluster
(id = 578)
General information about the entry
Representative name:
BNC2_cluster
Position:
chr9:15728010-17487696
# UCNEs:
43
Assiciated genes:
BNC2
;
C9orf93
;
CNTLN
;
Possible target genes:
BNC2
;
UCNEs forming the cluster:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chrZ:31778843-32705603
Associated genes:
MIR1779
;
PSIP1
;
SH3GL2
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr4:83661885-85119123
# UCNEs:
43
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr6:179692573-181912781
# UCNEs:
43
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
chrX5:16803284-17924259
# UCNEs:
41
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
Contig11868:8341-8580
# UCNEs:
1
UCNEs:
BNC2_Siddhartha
;
Subcluster #3
Position:
Contig3285:4725-4996
# UCNEs:
1
UCNEs:
BNC2_Bryan
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chrZ:58966197-59820476
# UCNEs:
43
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr2:35164761-36329204
# UCNEs:
42
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584653:112391-1266101
# UCNEs:
42
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Johanna
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Laura
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Ming
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172798:1133775-1935153
# UCNEs:
38
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Emi_1
;
BNC2_Emi_2
;
BNC2_Felix
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Hector
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Jeremy
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Nagasawa
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Noah
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Roman
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Toru
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_William
;
BNC2_Zeus
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:53380926-53624975
# UCNEs:
24
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_Zeus
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr1:20869178-21304480
# UCNEs:
26
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_Zeus
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrIX:7589435-7875288
# UCNEs:
25
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Demian
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Julia
;
BNC2_Kazuki
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Wei
;
BNC2_Zeus
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr18:7084550-7307240
# UCNEs:
22
UCNEs:
BNC2_Adela
;
BNC2_Akiko
;
BNC2_Aladdin
;
BNC2_Amos
;
BNC2_Antonio
;
BNC2_Ariane
;
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Bryan
;
BNC2_Claudia
;
BNC2_Daniel
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Siddhartha
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:88260771-88457996
# UCNEs:
2
UCNEs:
BNC2_Demian
;
BNC2_Florentino
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr1:25800972-26760096
# UCNEs:
17
UCNEs:
BNC2_Boris
;
BNC2_Brooklyn
;
BNC2_Florentino
;
BNC2_Helen
;
BNC2_Isaac
;
BNC2_Jonathan
;
BNC2_Lucifer
;
BNC2_Lucy
;
BNC2_Mateo
;
BNC2_Napoleon
;
BNC2_Ophelia
;
BNC2_Scheherazade
;
BNC2_Trystan
;
BNC2_Vincent
;
BNC2_Violet
;
BNC2_Wei
;
BNC2_Zeus
;