Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
AUTS2_cluster
(id = 516)
General information about the entry
Representative name:
AUTS2_cluster
Position:
chr7:69111243-70170090
# UCNEs:
34
Assiciated genes:
AUTS2
;
Possible target genes:
AUTS2
;
UCNEs forming the cluster:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Patricia
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr19:1954366-1362449
Associated genes:
MIR1567
;
MIR1587
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr5:131525153-132500693
# UCNEs:
34
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Patricia
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr2:510663016-511798740
# UCNEs:
33
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Contig10108:3170-3432
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
Contig105168:235-404
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Emi
;
Subcluster #3
Position:
Contig178999:915-1133
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Arthur
;
Subcluster #4
Position:
Contig23458:2115-7879
# UCNEs:
2
UCNEs:
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Chao
;
Subcluster #5
Position:
Contig26131:3888-8227
# UCNEs:
2
UCNEs:
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
Subcluster #6
Position:
Contig31941:5173-5465
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Eros
;
Subcluster #7
Position:
Contig40994:1369-5147
# UCNEs:
3
UCNEs:
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Ruby
;
Subcluster #8
Position:
Contig43259:812-1112
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Santiago
;
Subcluster #9
Position:
Contig502:654826-655072
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Maxwell
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr19:1533273-2286247
# UCNEs:
34
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Patricia
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chrUn_GL343583:4220-63037
# UCNEs:
5
UCNEs:
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_GL343720:4035-221116
# UCNEs:
24
UCNEs:
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Patricia
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_GL343851:1154-107707
# UCNEs:
2
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Arthur
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584468:2088596-3157976
# UCNEs:
33
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Evelyn_2
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Patricia
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172807:1419616-2136941
# UCNEs:
32
UCNEs:
AUTS2_Adela
;
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Carmen
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Clara_1
;
AUTS2_Clara_2
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Emi
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Evelyn_1
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Mignon_1
;
AUTS2_Mignon_2
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Penelope
;
AUTS2_Roman
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Sebastian
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
AUTS2_Xavier
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:309458221-309536954
# UCNEs:
13
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Ruby
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr14:23062152-23234250
# UCNEs:
17
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrVII:13669879-13779056
# UCNEs:
19
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Johanna
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Lukas
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Oberon
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Silvester
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr7:632219-705232
# UCNEs:
12
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Bryan
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Silvester
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:43404645-43404881
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Charlie
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_random:73671598-73672022
# UCNEs:
1
UCNEs:
AUTS2_Charlie
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr10:27886237-28169587
# UCNEs:
16
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Arthur
;
AUTS2_Beatrice
;
AUTS2_Brooklyn
;
AUTS2_Chao
;
AUTS2_Charlie
;
AUTS2_Daniel
;
AUTS2_Derek
;
AUTS2_Eros
;
AUTS2_Hamlet
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Ruby
;
AUTS2_Santiago
;
AUTS2_Silvester
;
AUTS2_Violet
;
Subcluster #2
Position:
chr15:18989551-19019226
# UCNEs:
4
UCNEs:
AUTS2_Ariel
;
AUTS2_Julia
;
AUTS2_Maxwell
;
AUTS2_Ruby
;