Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
MEIS1_cluster
(id = 289)
General information about the entry
Representative name:
MEIS1_cluster
Position:
chr2:65941809-68408085
# UCNEs:
45
Assiciated genes:
C1D
;
ETAA1
;
LOC644838
;
MEIS1
;
MIR4778
;
PNO1
;
PPP3R1
;
SPRED2
;
WDR92
;
Possible target genes:
MEIS1
;
UCNEs forming the cluster:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Paralogous cluster(s):
MEIS2_cluster
;
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr3:10107752-11189757
Associated genes:
ACTR2
;
C1D
;
LOC395589
;
PNO1
;
PPP3R1
;
WDR92
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr11:17198316-19679637
# UCNEs:
45
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr1:622793620-626005158
# UCNEs:
45
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Ultra56:6742871-8457945
# UCNEs:
45
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr3:2299097-3517167
# UCNEs:
45
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr1:124752696-126584025
# UCNEs:
44
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584519:2927509-3690598
# UCNEs:
30
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
Subcluster #2
Position:
JH584854:924285-1847792
# UCNEs:
15
UCNEs:
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Finn
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172644:4170283-5322260
# UCNEs:
41
UCNEs:
MEIS1_Virginia
;
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Traviata
;
MEIS1_Roman
;
MEIS1_Robert
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Othell
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Mustafa
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Mauritius_2
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jan
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hong
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Havana
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harshita
;
MEIS1_Harold
;
MEIS1_Hans
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Benjamin
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Apollo
;
MEIS1_Antigone
;
MEIS1_Alice
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:95971360-96224763
# UCNEs:
22
UCNEs:
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Alice
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr15:10289424-10747264
# UCNEs:
13
UCNEs:
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Alice
;
Subcluster #2
Position:
scaffold4796:739-960
# UCNEs:
1
UCNEs:
MEIS1_Ming
;
Stickleback (gasAcu1):
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr17:10133121-10363501
# UCNEs:
21
UCNEs:
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Jacob
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Hannibal
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Beatrice
;
MEIS1_Alice
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr13:4815743-5449768
# UCNEs:
25
UCNEs:
MEIS1_Veronica
;
MEIS1_Vanessa
;
MEIS1_Urania
;
MEIS1_Prometheus
;
MEIS1_Patricia
;
MEIS1_Nick
;
MEIS1_Nemo
;
MEIS1_Molly
;
MEIS1_Ming
;
MEIS1_Mauritius_1
;
MEIS1_Kazuki
;
MEIS1_Juan
;
MEIS1_Jeremy
;
MEIS1_Jasmine
;
MEIS1_Isolde
;
MEIS1_Isaac
;
MEIS1_Hector
;
MEIS1_Haruki
;
MEIS1_Harper
;
MEIS1_Gandalf
;
MEIS1_Eden
;
MEIS1_Claudia
;
MEIS1_Charlie
;
MEIS1_Cassandra
;
MEIS1_Beatrice
;