Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
PAX9_cluster
(id = 164)
General information about the entry
Representative name:
PAX9_cluster
Position:
chr14:35978979-37985423
# UCNEs:
32
Assiciated genes:
BRMS1L
;
FOXA1
;
INSM2
;
LOC100129794
;
MBIP
;
MIPOL1
;
MIR4503
;
NFKBIA
;
NKX2-1
;
NKX2-8
;
PAX9
;
RALGAPA1
;
SFTA3
;
SLC25A21
;
Possible target genes:
FOXA1
;
NKX2-1
;
NKX2-8
;
PAX9
;
UCNEs forming the cluster:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr5:38606981-39523362
Associated genes:
BRMS1L
;
NFKBIA
;
NKX2-1
;
PAX9
;
SSTR1
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr12:55566857-57467023
# UCNEs:
32
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr1:279273248-279932878
# UCNEs:
12
UCNEs:
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Subcluster #2
Position:
chr1:285949448-286225788
# UCNEs:
5
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
Subcluster #3
Position:
chr1:287111259-287871076
# UCNEs:
14
UCNEs:
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
Subcluster #4
Position:
chr1:288419072-288419414
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Napoleon
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
chr4:22430535-23590165
# UCNEs:
32
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr5:36187927-37187841
# UCNEs:
32
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr1:24100384-25475309
# UCNEs:
29
UCNEs:
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_1
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Vivien
;
PAX9_Wei
;
Subcluster #2
Position:
chr2:54353727-54354192
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_AAWZ02034921:28582-48449
# UCNEs:
2
UCNEs:
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
AHGY01534599:2-472
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Vivien
;
Subcluster #2
Position:
JH584766:2010731-2361218
# UCNEs:
8
UCNEs:
PAX9_Noah
;
PAX9_Pandora
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Tarzan
;
PAX9_Veronica
;
PAX9_Wei
;
Subcluster #3
Position:
JH584766:2899430-2983439
# UCNEs:
7
UCNEs:
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_1
;
PAX9_Maxwell_2
;
Subcluster #4
Position:
JH584837:1839423-2453416
# UCNEs:
8
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172781:1322325-2083822
# UCNEs:
22
UCNEs:
PAX9_Achilles
;
PAX9_Adam
;
PAX9_Amos
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Eduardo
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Eva_1
;
PAX9_Eva_2
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Mateo
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Poseidon
;
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Silvester
;
PAX9_Vivien
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:205952768-205952894
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Quentin
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:261829954-261932510
# UCNEs:
8
UCNEs:
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Lucy
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Poseidon
;
Subcluster #3
Position:
chrUn:318343421-318343680
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Carmen
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr22:154003-196959
# UCNEs:
4
UCNEs:
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
Subcluster #2
Position:
chr22:19318418-19323855
# UCNEs:
2
UCNEs:
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
Subcluster #3
Position:
scaffold2844:2792-3195
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Chen
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrXV:10834743-10973599
# UCNEs:
9
UCNEs:
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Jacob
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Poseidon
;
Subcluster #2
Position:
chrXV:13081083-13084072
# UCNEs:
2
UCNEs:
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr10:11096799-11197753
# UCNEs:
5
UCNEs:
PAX9_Chen
;
PAX9_Doris
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Poseidon
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:53197518-53197644
# UCNEs:
1
UCNEs:
PAX9_Quentin
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr17:10146634-10190594
# UCNEs:
5
UCNEs:
PAX9_Quentin
;
PAX9_Roman
;
PAX9_Santiago_1
;
PAX9_Santiago_2
;
PAX9_Vivien
;
Subcluster #2
Position:
chr17:12679929-12768312
# UCNEs:
3
UCNEs:
PAX9_Adam
;
PAX9_Carmen
;
PAX9_Charlie
;
Subcluster #3
Position:
chr17:38228870-38518711
# UCNEs:
7
UCNEs:
PAX9_Chen
;
PAX9_Emi
;
PAX9_Hana_2
;
PAX9_Leo
;
PAX9_Maxwell_2
;
PAX9_Napoleon
;
PAX9_Poseidon
;