Ultraconserved Genomic Regulatory Block: PAX9_cluster
(id = 164)

General information about the entry
Representative name:PAX9_cluster
Position:chr14:35978979-37985423
# UCNEs:32
Assiciated genes:BRMS1L; FOXA1; INSM2; LOC100129794; MBIP; MIPOL1; MIR4503; NFKBIA; NKX2-1; NKX2-8; PAX9; RALGAPA1; SFTA3; SLC25A21;
Possible target genes:FOXA1; NKX2-1; NKX2-8; PAX9;
UCNEs forming the cluster:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;
Paralogous cluster(s):

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Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr5:38606981-39523362
Associated genes: BRMS1L; NFKBIA; NKX2-1; PAX9; SSTR1;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr12:55566857-57467023
# UCNEs:32
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr1:279273248-279932878
# UCNEs:12
UCNEs:PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;
Subcluster #2

Position:

chr1:285949448-286225788
# UCNEs:5
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie;
Subcluster #3

Position:

chr1:287111259-287871076
# UCNEs:14
UCNEs:PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2;
Subcluster #4

Position:

chr1:288419072-288419414
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Napoleon;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

chr4:22430535-23590165
# UCNEs:32
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr5:36187927-37187841
# UCNEs:32
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr1:24100384-25475309
# UCNEs:29
UCNEs:PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_1; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Silvester; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Vivien; PAX9_Wei;
Subcluster #2

Position:

chr2:54353727-54354192
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Achilles;
Subcluster #3

Position:

chrUn_AAWZ02034921:28582-48449
# UCNEs:2
UCNEs:PAX9_Adam; PAX9_Amos;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

AHGY01534599:2-472
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Vivien;
Subcluster #2

Position:

JH584766:2010731-2361218
# UCNEs:8
UCNEs:PAX9_Noah; PAX9_Pandora; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Tarzan; PAX9_Veronica; PAX9_Wei;
Subcluster #3

Position:

JH584766:2899430-2983439
# UCNEs:7
UCNEs:PAX9_Eva_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_1; PAX9_Maxwell_2;
Subcluster #4

Position:

JH584837:1839423-2453416
# UCNEs:8
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172781:1322325-2083822
# UCNEs:22
UCNEs:PAX9_Achilles; PAX9_Adam; PAX9_Amos; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie; PAX9_Doris; PAX9_Eduardo; PAX9_Emi; PAX9_Eva_1; PAX9_Eva_2; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Mateo; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Poseidon; PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Silvester; PAX9_Vivien;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:205952768-205952894
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Quentin;
Subcluster #2

Position:

chrUn:261829954-261932510
# UCNEs:8
UCNEs:PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Hana_2; PAX9_Leo; PAX9_Lucy; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Poseidon;
Subcluster #3

Position:

chrUn:318343421-318343680
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Carmen;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr22:154003-196959
# UCNEs:4
UCNEs:PAX9_Hana_2; PAX9_Leo; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon;
Subcluster #2

Position:

chr22:19318418-19323855
# UCNEs:2
UCNEs:PAX9_Carmen; PAX9_Charlie;
Subcluster #3

Position:

scaffold2844:2792-3195
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Chen;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrXV:10834743-10973599
# UCNEs:9
UCNEs:PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Emi; PAX9_Hana_2; PAX9_Jacob; PAX9_Leo; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Poseidon;
Subcluster #2

Position:

chrXV:13081083-13084072
# UCNEs:2
UCNEs:PAX9_Carmen; PAX9_Charlie;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr10:11096799-11197753
# UCNEs:5
UCNEs:PAX9_Chen; PAX9_Doris; PAX9_Emi; PAX9_Napoleon; PAX9_Poseidon;
Subcluster #2

Position:

chrUn_random:53197518-53197644
# UCNEs:1
UCNEs:PAX9_Quentin;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr17:10146634-10190594
# UCNEs:5
UCNEs:PAX9_Quentin; PAX9_Roman; PAX9_Santiago_1; PAX9_Santiago_2; PAX9_Vivien;
Subcluster #2

Position:

chr17:12679929-12768312
# UCNEs:3
UCNEs:PAX9_Adam; PAX9_Carmen; PAX9_Charlie;
Subcluster #3

Position:

chr17:38228870-38518711
# UCNEs:7
UCNEs:PAX9_Chen; PAX9_Emi; PAX9_Hana_2; PAX9_Leo; PAX9_Maxwell_2; PAX9_Napoleon; PAX9_Poseidon;