Ultraconserved Genomic Regulatory Block: PITX2_cluster
(id = 401)

General information about the entry
Representative name:PITX2_cluster
Position:chr4:111538763-113444689
# UCNEs:22
Assiciated genes:ALPK1; AP1AR; C4orf21; C4orf32; NEUROG2; PITX2; TIFA;
Possible target genes:PITX2;
UCNEs forming the cluster:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;
Paralogous cluster(s):

View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chr4:59368166-58689718
Associated genes: ELOVL6; PITX2;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr3:127625906-129219414
# UCNEs:22
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr5:63556854-65139356
# UCNEs:18
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus;
Subcluster #2

Position:

chr5:65785764-65936431
# UCNEs:4
UCNEs:PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

Contig22045:6220-6506
# UCNEs:1
UCNEs:PITX2_Prometheus;
Subcluster #2

Position:

Ultra445:1532491-2917391
# UCNEs:21
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chr4:2600652-2644145
# UCNEs:4
UCNEs:PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;
Subcluster #2

Position:

chr4:24443795-24974092
# UCNEs:18
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr5:143034177-143979529
# UCNEs:22
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584529:5008570-6150566
# UCNEs:21
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Felix; PITX2_Frankenstein; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Prometheus; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172725:89472-1003360
# UCNEs:20
UCNEs:PITX2_Amadeus; PITX2_Ariane; PITX2_Atsuko; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Felix; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Jan; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope; PITX2_Roxane; PITX2_Silvester; PITX2_Vladimir; PITX2_Zhong;
Subcluster #2

Position:

GL173104:2162-2449
# UCNEs:1
UCNEs:PITX2_Prometheus;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:22728787-22820360
# UCNEs:9
UCNEs:PITX2_Ariane; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Jacob; PITX2_Lincoln; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

ultracontig115:4640926-4817109
# UCNEs:9
UCNEs:PITX2_Ariane; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrIV:1824608-1928407
# UCNEs:12
UCNEs:PITX2_Ariane; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Derek; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr20:1732454-1825042
# UCNEs:8
UCNEs:PITX2_Ariane; PITX2_Clara; PITX2_Claudia; PITX2_Jacob; PITX2_Lincoln; PITX2_Mignon; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr14:37181031-37434360
# UCNEs:10
UCNEs:PITX2_Ariane; PITX2_Claudia; PITX2_Helen; PITX2_Jacob; PITX2_Lincoln; PITX2_Lukas; PITX2_Mignon; PITX2_Ming; PITX2_Naomi; PITX2_Penelope;