Computational Cancer Genomics
 |
ExPASy
Database access
Browse UCNE clusters
Browse indvidual UCNEs
View paralogous clusters
View paralogous UCNEs
Species cluster summary
Search by external IDs
Advanced search
Download
Download UCNEbase
FTP site
Documentation
References
Acknowledgments
Other Resources
Contact us
Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
PROX1_cluster
(id = 16)
General information about the entry
Representative name:
PROX1_cluster
Position:
chr1:213332779-214359926
# UCNEs:
31
Assiciated genes:
LINC00538
;
PROX1
;
PROX1-AS1
;
RPS6KC1
;
SMYD2
;
Possible target genes:
PROX1
;
SMYD2
;
UCNEs forming the cluster:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Paralogous cluster(s):
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr3:22839478-22378273
Associated genes:
ANGEL2
;
PROX1
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr1:189990273-190853986
# UCNEs:
31
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr2:121531333-122860213
# UCNEs:
31
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Ultra67:2646703-3222693
# UCNEs:
31
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr3:12301633-12796850
# UCNEs:
31
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr1:238900031-239735172
# UCNEs:
31
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584537:636459-1283480
# UCNEs:
28
UCNEs:
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Leontina
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Pablo
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Traviata
;
PROX1_Ursula
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172744:1692412-2211093
# UCNEs:
27
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Amos
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Clara
;
PROX1_Delphina
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eros
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Figaro
;
PROX1_Frankenstein
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Kizuki
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Napoleon
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;
PROX1_Tarzan_2
;
PROX1_Ursula
;
Subcluster #2
Position:
GL176026:1647-1910
# UCNEs:
1
UCNEs:
PROX1_Traviata
;
Subcluster #3
Position:
GL188280:3154-3363
# UCNEs:
1
UCNEs:
PROX1_Leontina
;
Subcluster #4
Position:
GL188943:12-387
# UCNEs:
1
UCNEs:
PROX1_Jun
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:123618047-123689954
# UCNEs:
2
UCNEs:
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Naomi
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:143446054-143491961
# UCNEs:
4
UCNEs:
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Quentin
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr2:20100994-20101134
# UCNEs:
1
UCNEs:
PROX1_Naomi
;
Subcluster #2
Position:
chr24:8881654-8987004
# UCNEs:
7
UCNEs:
PROX1_Demian
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Quentin
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrXVIII:9981379-10053079
# UCNEs:
5
UCNEs:
PROX1_Demian
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Noah
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr14:5177360-5216280
# UCNEs:
2
UCNEs:
PROX1_Griselda
;
PROX1_Noah
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:82971536-82971625
# UCNEs:
1
UCNEs:
PROX1_Hong_2
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr17:33018650-33348984
# UCNEs:
18
UCNEs:
PROX1_Abraham
;
PROX1_Ariel
;
PROX1_Atsuko
;
PROX1_Demian
;
PROX1_Eva
;
PROX1_Griselda
;
PROX1_Hong_1
;
PROX1_Hong_2
;
PROX1_Jan
;
PROX1_Joshua
;
PROX1_Jun
;
PROX1_Larisa
;
PROX1_Lucy
;
PROX1_Maxwell
;
PROX1_Naomi
;
PROX1_Noah
;
PROX1_Quentin
;
PROX1_Tarzan_1
;