Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
SALL3_cluster
(id = 245)
General information about the entry
Representative name:
SALL3_cluster
Position:
chr18:75544796-77044092
# UCNEs:
33
Assiciated genes:
ATP9B
;
GALR1
;
SALL3
;
Possible target genes:
SALL3
;
UCNEs forming the cluster:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Paralogous cluster(s):
IRXB_cluster
;
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr2:58781544-57882567
Associated genes:
PRL
;
SALL3
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr18:80787700-81852865
# UCNEs:
33
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr3:307769511-309575671
# UCNEs:
29
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
Subcluster #2
Position:
chr3:310095490-310158072
# UCNEs:
4
UCNEs:
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Contig29047:3392-4107
# UCNEs:
2
UCNEs:
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
Subcluster #2
Position:
Contig47281:550-4914
# UCNEs:
3
UCNEs:
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
Subcluster #3
Position:
Ultra314:320401-713339
# UCNEs:
14
UCNEs:
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Subcluster #4
Position:
Ultra337:957140-970192
# UCNEs:
2
UCNEs:
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
Subcluster #5
Position:
Ultra88:8902-131234
# UCNEs:
8
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr2:74104819-74924444
# UCNEs:
33
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr4:51421960-52424227
# UCNEs:
33
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584442:5389350-6762536
# UCNEs:
30
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Arcadia
;
SALL3_Ara
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adriana
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172849:15378-391397
# UCNEs:
10
UCNEs:
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abdullah
;
SALL3_Abbey
;
SALL3_Aaron
;
Subcluster #2
Position:
GL173377:23140-35859
# UCNEs:
2
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
Subcluster #3
Position:
GL173521:18663-216289
# UCNEs:
18
UCNEs:
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Arden
;
SALL3_Archangel
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Aoife
;
Subcluster #4
Position:
GL175079:17877-18117
# UCNEs:
1
UCNEs:
SALL3_Adriana
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:203170227-203314398
# UCNEs:
17
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Ada
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:317861727-317901498
# UCNEs:
3
UCNEs:
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Abdullah
;
Subcluster #3
Position:
chrUn:386704793-386704941
# UCNEs:
1
UCNEs:
SALL3_Arnaud
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr11:18620037-18659728
# UCNEs:
4
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Abdullah
;
Subcluster #2
Position:
ultracontig182:1459911-1790062
# UCNEs:
24
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cornelia
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Ada
;
SALL3_Abbey
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrX:2190941-2240483
# UCNEs:
6
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Abdullah
;
Subcluster #2
Position:
chrXX:4178670-4355368
# UCNEs:
23
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Barack
;
SALL3_Ava
;
SALL3_Arnaud
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Ara
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Adem
;
SALL3_Ada
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr8:2501604-2636360
# UCNEs:
19
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_April
;
SALL3_Apollonia
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Ada
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr16:7649867-7905462
# UCNEs:
15
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Dimitri
;
SALL3_Dakota
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Ariel
;
SALL3_Ariana
;
SALL3_Ari
;
SALL3_Argenta
;
SALL3_Apollo
;
SALL3_Aphrodite
;
SALL3_Antonio
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agatha
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Ada
;
Subcluster #2
Position:
chr19:22441887-22606080
# UCNEs:
7
UCNEs:
SALL3_Dylan
;
SALL3_Cecilia
;
SALL3_Bernard
;
SALL3_Anna
;
SALL3_Agnes
;
SALL3_Adela
;
SALL3_Abdullah
;