Computational Cancer Genomics
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Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
SATB1_cluster
(id = 357)
General information about the entry
Representative name:
SATB1_cluster
Position:
chr3:17327663-19034380
# UCNEs:
37
Assiciated genes:
KCNH8
;
LOC339862
;
SATB1
;
TBC1D5
;
Possible target genes:
SATB1
;
UCNEs forming the cluster:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Paralogous cluster(s):
SATB2_cluster
;
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr2:34671683-35450108
Associated genes:
DAZL
;
RAB5A
;
SATB1
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr17:50842411-52465650
# UCNEs:
37
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr8:277250926-279321067
# UCNEs:
37
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Ultra239:369618-1619233
# UCNEs:
37
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr2:54806348-55587783
# UCNEs:
37
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chr6:33344387-34540447
# UCNEs:
37
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584682:4321039-5471192
# UCNEs:
32
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Eros
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Flora
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Tatiana
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
JH585703:25235-25500
# UCNEs:
1
UCNEs:
SATB1_Jonathan
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172662:3476668-4156743
# UCNEs:
33
UCNEs:
SATB1_Abraham
;
SATB1_Achilles
;
SATB1_Alexander
;
SATB1_Amadeus
;
SATB1_Antigone
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Cameron
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Derek
;
SATB1_Eduardo
;
SATB1_Evelyn_1
;
SATB1_Evelyn_2
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jan
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Mauritius
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Quentin
;
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Santiago
;
SATB1_Scheherazade
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Vladimir
;
SATB1_Wagner
;
SATB1_Xavier
;
Subcluster #2
Position:
GL175187:2450-2886
# UCNEs:
1
UCNEs:
SATB1_Eros
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:214917485-214985305
# UCNEs:
8
UCNEs:
SATB1_Bryan
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:230844238-230878986
# UCNEs:
6
UCNEs:
SATB1_Roxane
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Wagner
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr16:27754564-27986660
# UCNEs:
11
UCNEs:
SATB1_Achilles
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Vivien
;
Subcluster #2
Position:
scaffold6244:2709-2945
# UCNEs:
1
UCNEs:
SATB1_Wagner
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrXX:15121711-15277799
# UCNEs:
17
UCNEs:
SATB1_Achilles
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Vivien
;
SATB1_Wagner
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chrUn_random:29561081-29726877
# UCNEs:
15
UCNEs:
SATB1_Achilles
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ming
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Tarzan
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Wagner
;
Subcluster #2
Position:
chrUn_random:65218804-65218977
# UCNEs:
1
UCNEs:
SATB1_Tarzan
;
Subcluster #3
Position:
chrUn_random:71878020-71878356
# UCNEs:
1
UCNEs:
SATB1_Bryan
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr16:52595612-53002021
# UCNEs:
14
UCNEs:
SATB1_Achilles
;
SATB1_Bryan
;
SATB1_Carmen
;
SATB1_Cassandra
;
SATB1_Charlie
;
SATB1_Frederica
;
SATB1_Jeremy
;
SATB1_Jonathan
;
SATB1_Lily
;
SATB1_Maxwell
;
SATB1_Ryan
;
SATB1_Sam
;
SATB1_Veronica
;
SATB1_Wagner
;