Computational Cancer Genomics
 |
ExPASy
Database access
Browse UCNE clusters
Browse indvidual UCNEs
View paralogous clusters
View paralogous UCNEs
Species cluster summary
Search by external IDs
Advanced search
Download
Download UCNEbase
FTP site
Documentation
References
Acknowledgments
Other Resources
Contact us
Ultraconserved Genomic Regulatory Block:
SMAD3_cluster
(id = 192)
General information about the entry
Representative name:
SMAD3_cluster
Position:
chr15:67199281-68080218
# UCNEs:
21
Assiciated genes:
AAGAB
;
C15orf61
;
IQCH
;
LOC100506686
;
MAP2K5
;
SMAD3
;
SMAD6
;
Possible target genes:
SMAD3
;
SMAD6
;
UCNEs forming the cluster:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Paralogous cluster(s):
SMAD2_cluster
;
View cluster image
Conservation in chicken:
Chicken (galGal3):
Position:
chr10:20917286-21217027
Associated genes:
MAP2K5
;
SMAD3
;
SMAD6
;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1
Position:
chr9:63176391-63881226
# UCNEs:
21
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Opossum (monDom5):
Subcluster #1
Position:
chr1:153535419-153575833
# UCNEs:
3
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
Subcluster #2
Position:
chr1:154216620-154721837
# UCNEs:
18
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Platypus (ornAna1):
Subcluster #1
Position:
Contig102:1119312-1830380
# UCNEs:
20
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
Contig35049:1062-1437
# UCNEs:
1
UCNEs:
SMAD3_Nick
;
Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1
Position:
chr10:19487594-19829020
# UCNEs:
19
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Lizard (anoCar2):
Subcluster #1
Position:
chrUn_GL343467:267046-615145
# UCNEs:
21
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1
Position:
JH584716:4931781-5610287
# UCNEs:
21
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Xavier
;
SMAD3_Zeus
;
Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1
Position:
GL172676:80068-202696
# UCNEs:
16
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Naomi
;
SMAD3_Napoleon
;
SMAD3_Nick
;
SMAD3_Noah
;
SMAD3_Oberon
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
GL172999:1132271-1139409
# UCNEs:
3
UCNEs:
SMAD3_Atsuko_1
;
SMAD3_Atsuko_2
;
SMAD3_Dorian
;
Fugu (fr2):
Subcluster #1
Position:
chrUn:3440919-3476621
# UCNEs:
7
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
chrUn:8561639-8599599
# UCNEs:
11
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Zeus
;
Medaka (oryLat2):
Subcluster #1
Position:
chr3:11064459-11132375
# UCNEs:
9
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
chr6:11229288-11286640
# UCNEs:
10
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Zeus
;
Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1
Position:
chrII:18621821-18660346
# UCNEs:
7
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
Subcluster #2
Position:
chrXIX:6661346-6706737
# UCNEs:
11
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vera
;
SMAD3_Zeus
;
Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1
Position:
chr13:8147309-8178387
# UCNEs:
9
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Midori
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
Subcluster #2
Position:
chr5:10308916-10343671
# UCNEs:
7
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Vanessa
;
SMAD3_Zeus
;
Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1
Position:
chr18:19614225-19749936
# UCNEs:
8
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Isolde
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Logan
;
SMAD3_Malcolm
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Zeus
;
Subcluster #2
Position:
chr7:35316149-35431394
# UCNEs:
6
UCNEs:
SMAD3_Hannibal_1
;
SMAD3_Hannibal_2
;
SMAD3_Larisa
;
SMAD3_Robert
;
SMAD3_Sam
;
SMAD3_Zeus
;