Ultraconserved Genomic Regulatory Block: TNPO1_cluster
(id = 451)

General information about the entry
Representative name:TNPO1_cluster
Position:chr5:72204530-72634467
# UCNEs:5
Assiciated genes:FCHO2; FOXD1; TMEM171; TMEM174; TNPO1;
Possible target genes:TNPO1;
UCNEs forming the cluster:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;
Paralogous cluster(s):

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Conservation in chicken:
Chicken (galGal3): Position: chrZ:25900294-25671673
Associated genes: CBWD1; NSA2;
Conservation in other species:
Mouse (mm10):
Subcluster #1

Position:

chr13:98476724-98844627
# UCNEs:5
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Opossum (monDom5):
Subcluster #1

Position:

chr3:47065491-47068746
# UCNEs:3
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica;
Subcluster #2

Position:

chr3:47610397-47695092
# UCNEs:2
UCNEs:TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Platypus (ornAna1):
Subcluster #1

Position:

chr1:13284139-13533256
# UCNEs:4
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal;


Zebra_finch (taeGut1):
Subcluster #1

Position:

chrZ:66287712-66512107
# UCNEs:5
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Lizard (anoCar2):
Subcluster #1

Position:

chr2:16057615-16272891
# UCNEs:5
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Painted_turtle (chrPic1):
Subcluster #1

Position:

JH584533:9963895-10428670
# UCNEs:5
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Xenopus (xenTro3):
Subcluster #1

Position:

GL172749:820559-1017273
# UCNEs:5
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Florentino; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;


Fugu (fr2):
Subcluster #1

Position:

chrUn:111538006-111591309
# UCNEs:2
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Hannibal;


Medaka (oryLat2):
Subcluster #1

Position:

chr12:4650909-4651149
# UCNEs:1
UCNEs:TNPO1_Hannibal;


Stickleback (gasAcu1):
Subcluster #1

Position:

chrXIV:1367079-1417004
# UCNEs:2
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Hannibal;


Tetraodon (tetNig2):
Subcluster #1

Position:

chr4:5949745-5949995
# UCNEs:1
UCNEs:TNPO1_Hannibal;


Zebrafish (danRer7):
Subcluster #1

Position:

chr5:36658095-36823076
# UCNEs:4
UCNEs:TNPO1_Emi; TNPO1_Frederica; TNPO1_Hannibal; TNPO1_Xavier;